Это приложение для Linux под названием Digital Expression в Интернете, последнюю версию которого можно загрузить как dew_RC2.tar.bz2. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Digital Expression в Интернете с помощью OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
Цифровое выражение в Интернете
Ad
ОПИСАНИЕ
DEW - это платформа, которая позволяет пользователям исследовать данные RNA-Seq. Включен графический пользовательский веб-интерфейс.
Анализ продолжается как таковой: выравнивания с пробелами выполняются и корректируются по длине, ПЦР и смещению фрагментов, так что оценивается количество фрагментов на (эффективный) килобаз на миллион считываний (FPKM), а также более простые чтения на килобайт на миллион считываний ( РПКМ). При предоставлении нескольких изоформ и в «контекстном» режиме исправления включают в себя алгоритм максимизации ожидания, оценивающий эффективные профили экспрессии, и производится скорректированное выравнивание. Для каждого гена, предоставленного пользователем, DEW вычисляет описательную статистику охвата (RPKM, FKMP и общие, средние и средние скорректированные значения), профили экспрессии (нормализованные как R / FPKM и усеченное среднее кратное изменение). DEW позволяет пользователям исследовать данные, предоставляя интерактивные графики.
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Веб-
Язык программирования
Perl, JavaScript, S / R
Среда базы данных
SQLite
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/dew/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
