Это приложение для Linux под названием EigenMS для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как EigenMS.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием EigenMS, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
EigenMS для запуска в Linux онлайн
Ad
ОПИСАНИЕ
EigenMS - это метод нормализации, реализованный в R (и более старой версии в Matlab), доступный как набор из двух функций, которые следует использовать в последовательности.Загрузите файл EigenMS.zip (последнюю версию).
Последняя версия, загруженная в октябре 2017 года, содержит исправление для нормализации одной группы лечения.
Изменение масштаба не производилось с 2015 года.
EigenMS использует SVD для обнаружения тенденций смещения данных и их устранения. EigenMS устраняет влияние известных и неизвестных факторов и может использоваться на любой атомной платформе.
Мы показали его полезность в ЖХ-МС / МС и метаболомике в следующих двух статьях:
1) PMID: 19602524. «Нормализация пиковых интенсивностей в восходящей МС-протеомике с использованием сингулярного разложения».
Карпиевич Ю.В., Тавернер Т., Адкинс Дж. Н., Каллистер С.Дж., Андерсон Г.А., Смит Р.Д., Дабни А.Р.
Биоинформатика 2009
2) «Нормализация метаболомических данных с помощью EigenMS»
Карпиевич Ю.В., Николич С.Б., Уилсон Р., Шарман Дж. Э., Эдвардс Л.М.
ПЛоС Один 2014
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
MATLAB, S / R
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/eigenms/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
