Это приложение для Linux под названием High-Throughput Tabular Data Processor, последнюю версию которого можно загрузить как htdpinstaller.exe. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием High-Throughput Tabular Data Processor with OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Высокопроизводительный процессор табличных данных
ОПИСАНИЕ
ПРОЦЕССОР ТАБЛИЧНЫХ ДАННЫХ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНЫЙ (HTDP) - это приложение Java, предназначенное для облегчения задач исследования и сокращения данных в больших текстовых файлах, возникающих в результате использования высокопроизводительных технологий, например, массового параллельного секвенирования или микрочипов. Программное обеспечение оптимизировано для микрочипов и данных глубокого параллельного секвенирования, однако оно может принимать любые табличные наборы данных с разделителями в виде символов. HTDP также может импортировать, обрабатывать и преобразовывать файлы Variant Call Format (VCF) вер. 4.0, 4.1 и 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP обеспечивает быструю фильтрацию и может обрабатывать данные, состоящие из одного или нескольких входных файлов.
Цитирование: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) Высокопроизводительный процессор табличных данных - независимый от платформы графический инструмент для обработки больших наборов данных. PLoS ONE 13 (2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Особенности
- работает с любыми данными столбца, разделенными символами (например, BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- объединять файлы табличных данных по вертикали и горизонтали
- объединить любые файлы табличных данных, используя местоположение генома или общие столбцы
- неограниченные возможности фильтрации и сокращения данных
- разные файлы по формату и содержанию могут быть проанализированы одновременно
Язык программирования
Java
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/htdp/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
