Это приложение для Linux под названием MAGeCK, последний выпуск которого можно загрузить как broadgpp-brunello-library-corrected.txt.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием MAGeCK с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
МАГЕК
ОПИСАНИЕ
Модельный анализ нокаута CRISPR-Cas9 в масштабе всего генома (MAGeCK) - это вычислительный инструмент для идентификации важных генов с помощью недавней технологии нокаута CRISPR-Cas9 в масштабе генома.
Инструкции и документацию можно найти на вики-странице.
MAGeCK разработан Вэй Ли и Хань Сюй из лаборатории доктора Сяоле Ширли Лю в Онкологическом институте Дана-Фарбер / Гарвардской школе общественного здравоохранения и поддерживается лабораторией Вей Ли в Детском национальном медицинском центре. Мы благодарим за поддержку программы Клаудии Адамс Барр в инновационных фундаментальных исследованиях рака и NIH / NHGRI за разработку MAGeCK.
Особенности
- Самый популярный вычислительный алгоритм в скрининговом анализе
- Более 400 цитирований и 60k скачиваний
- Простой и легкий в использовании конвейер для скрининга генов в общегеномных экспериментах с нокаутом CRISPR-Cas9
- Полная документация с простыми учебными пособиями
- Высокая чувствительность и низкий уровень ложного обнаружения
- Активное поддержание исходного кода с новыми функциями и исправлениями ошибок
- Поддержка со стороны разработчиков и сообщества пользователей
- Набор функций визуализации, позволяющих генерировать стандартные цифры публикации
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
Питон, С
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/mageck/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
