Это приложение для Linux под названием MendelChecker, последнюю версию которого можно загрузить как MendelChecker_v2.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием MendelChecker с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
МендельЧекер
Ad
ОПИСАНИЕ
MendelChecker - это основанная на правдоподобии мера менделирующей сегрегации однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в ядерных родословных. Мы разработали этот метод в качестве меры контроля качества для обнаружения новых вариантов на основе зашумленных данных секвенирования следующего поколения в родословных, таких как секвенирование ДНК, связанное с рестрикционным сайтом (RAD-seq), у немодельных организмов. Этот метод реализует сравнение гетерогаметной и гомогаметной передачи, т. Е. Сцепленной по полу и аутосомной сегрегации.
Особенности
- Измерьте вероятность менделевской передачи в родословных
- Отнесение аутосом к половым хромосомам
- Читает стандартный вывод GATK
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/mendelchecker/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
