Это приложение для Linux под названием «Калькулятор сходства продуктов Natural», последний выпуск которого можно загрузить как Natural_Product_Likeness_calculator_2.1.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием «Калькулятор сходства натуральных продуктов» с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
Калькулятор сходства натуральных продуктов
Ad
ОПИСАНИЕ
Вычисляет сходство молекулы с природным продуктом (NP), т. Е. Сходство молекулы со структурным пространством, охватываемым известными натуральными продуктами. NP-подобие - полезный критерий для скрининга библиотек соединений и для разработки новых ведущих соединений.
Зависимость от Maven:
uk.ac.ebi.cheminformatics
NP-подобие
2.1
Требуемый репозиторий:
эби-репо
Репозиторий EBI maven
http://www.ebi.ac.uk/~maven/m2repo
ложный
Последняя версия проекта доступна здесь, в нашем репозитории GIT. https://github.com/CS76/NP-Likeness
Особенности
- Проверить наличие избыточных структур в наборе данных
- Стандартизация молекул (Удаление противоионов и металлов)
- Удалите линейный и кольцевой сахар
- Сгенерировать подписи атома
- Рассчитайте сходство данной молекулы с натуральным продуктом на основе доступных открытых данных о натуральных продуктах.
- SDF и SMILES для ввода / вывода
- Используйте свой собственный набор тренировок для подсчета баллов
Язык программирования
Java
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/np-likeness/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
