Это приложение для Linux под названием Prokka, последнюю версию которого можно скачать как v1.14.5sourcecode.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Prokka с помощью OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Прокка
ОПИСАНИЕ
Prokka — это инструмент командной строки и конвейер для быстрой аннотации прокариотических геномов (бактерий, архей, вирусов), создающий соответствующие стандартам выходные файлы, подходящие для анализа генома.
Особенности
- Быстрая аннотация всего генома с использованием нескольких инструментов аннотации
- Создает стандартизированные выходные форматы (GenBank, EMBL, GFF)
- Разработан для быстрой обработки черновых сборок (~10 минут на обычном настольном компьютере)
- Координирует существующие инструменты биоинформатики (например, Prodigal для обнаружения ОРС)
- Возможность установки через Bioconda для легкой настройки в биоинформатических средах
- Результаты готовы для дальнейшего анализа или отображения в браузере генома.
Язык программирования
Perl
Категории
Это приложение также можно скачать по адресу https://sourceforge.net/projects/prokka.mirror/. Оно размещено на OnWorks для максимально удобного запуска онлайн через одну из наших бесплатных операционных систем.
