Это приложение для Linux под названием RNAseqR, последнюю версию которого можно загрузить как RNAseqR_1.1.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием RNAseqR с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
РНКсекР
ОПИСАНИЕ
RNAseqR разработан для анализа экспрессии данных RNA-seq и лучше всего подходит для анализа множества нереплицированных библиотек. Это программа в коде C ++, которая в настоящее время скомпилирована для систем Linux.
С помощью интерфейсов графического интерфейса и командной строки он может выполнять преобразования журнала, PPM и / или RPKM (если указана длина), а также статистический анализ для дифференциального выражения, используя отрицательную биномиальную кумулятивную функцию распределения (CDF) или статистику R-теста. представленный для анализа EST Stekel, et al.
Выходные данные позволяют принимать решения на основе вероятностей CDF, верхних значений R или сравнения значений R со случайными данными. Сравнения - это показатель достоверности, предложенный Стекелем и др., Или наблюдаемый и ожидаемый R при заданном среднем выражении. Рандомизация осуществляется с помощью пуассоновского или отрицательного биномиального распределения или перемешивания столбцов.
Язык программирования
C + +
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/rnaseqr/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
