Это приложение для Linux под названием SOAPdenovo2, последний выпуск которого можно загрузить как SOAPdenovo2-src-r240.tgz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием SOAPdenovo2 с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
SOAPденово2
Ad
ОПИСАНИЕ
Что дальше SOAPdenovo2:
MEGAHIT - формальный преемник SOAPdenovo2.
MEGAHIT: сверхбыстрое одноузловое решение для крупномасштабной и сложной сборки метагеномики с помощью сжатого графа де Брейна.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
Последний код на GitHub:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo - это новый метод сборки с коротким чтением, с помощью которого можно построить черновую сборку de novo для геномов человеческого размера. Программа специально разработана для сборки коротких чтений Illumina. Это создает новые возможности для создания эталонных последовательностей и проведения точного анализа неизученных геномов экономичным способом. SOAPdenovo2 является преемником SOAPdenovo. Если вы хотите процитировать SOAPdenovo2, цитируйте статью, опубликованную в GigaScience (см. Веб-сайт ниже).
Аудитория
Наука / Исследования, Разработчики
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
C ++, C
Среда базы данных
Плоский файл
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.