Это приложение для Linux под названием SW #, последний выпуск которого можно загрузить как swsharp-src.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием SW # с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
SW #
Ad
ОПИСАНИЕ
SW # (swsharp) - это библиотека для выравнивания последовательностей на основе графических процессоров с поддержкой CUDA. Он использует алгоритм Хиршбергса и Укконенса для повышения эффективности памяти и дополнительного ускорения. Библиотека масштабируется для использования с несколькими графическими процессорами. Некоторые части библиотеки используют MPI для кластеров с поддержкой CUDA.Работа частично поддержана Хорватским научным фондом в рамках проекта UIP-11-2013-7353.
Теперь доступен поиск по базе данных!
Публикации:
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0145857
http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/29/19/2494
http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/11/23/nar.gkt1164.abstract#!
Связанных с работой:
http://exolocator.bii.a-star.edu.sg/
НОВИНКА:
SW # веб-версия:
http://swsharp.zesoi.fer.hr/
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/swsharp/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
