Это приложение для Linux под названием SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster для бесплатного запуска в Linux онлайн с OnWorks.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
SWAPHI-LS: согласование на кластере Xeon Phi для работы в Linux онлайн
Ad
ОПИСАНИЕ
Первый параллельный алгоритм Смита-Ватермана, использующий кластеры Intel Xeon Phi для ускорения выравнивания длинных последовательностей ДНК. Этот алгоритм написан на C ++ (с набором внутренних расширений SIMD), OpenMP и MPI. Оценка производительности показала, что наш алгоритм обеспечивает очень стабильную производительность и производительность до 30.1 GCUPS на одном Xeon Phi и до 111.4 GCUPS на четырех Xeon Phis, совместно использующих хост.Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Консоль / Терминал, Командная строка
Язык программирования
C + +
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
