Это приложение для Linux под названием VIGOR3, последнюю версию которого можно загрузить как VIGOR3.tgz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием VIGOR3 с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
ВИГОР3
ОПИСАНИЕ
VIGOR - это инструмент для аннотирования кодирующих генов в вирусных геномах. Он был разработан Джеффри Гувером и Шилянгом Вангом для Центра геномного секвенирования инфекционных заболеваний JCVI (GSCID).
http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2105-11-451.pdf
обращаться:
Джефф Гувер
301-540-7858
[электронная почта защищена]
Особенности
- понимает редактирование РНК, проскальзывание рибосом, считывание стоп-кодонов и альтернативные стартовые кодоны
- аннотирует зрелые пептиды на полипротеинах
- обрабатывает сплайсированные, перекрывающиеся и встроенные гены
- обрабатывает кольцевые, частичные и черновые (пробивные) геномы
- диагностирует сдвиги рамы в сборке
- включает справочные наборы данных по более чем 50 видам
- включает инструменты для создания новых наборов справочных данных
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Perl
Среда базы данных
SQLite
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/vigor3/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.