Это приложение для Linux под названием Virmid, последний выпуск которого можно загрузить как Virmid-1.2.0.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Virmid с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
Вермид
ОПИСАНИЕ
НОВОСТИ:
11 Выложена новая версия Вирмид 07.
08 Статья о Вирмиде опубликована в журнале Genome Biology.
Ким С. и др., «Вирмид: точное обнаружение соматических мутаций с выводом примесей в образце», Genome Biology 2013, 14: R90
http://genomebiology.com/2013/14/8/R90/abstract
Virmid (Virtual Microdissection для вызова SNP) — это вызывающая программа на основе Java, предназначенная для сопоставления образцов для контроля заболеваний. Virmid также специализируется на выявлении потенциальной индивидуальной контаминации, когда образец болезни не может быть достаточно очищен. В то время как частота вызовов SNP серьезно снижается из-за этой неоднородности, Virmid может обнаруживать SNP с низкой частотой аллеля, учитывая уровень загрязнения (альфа). Важными особенностями Virmid являются:
• Оценка точной доли контрольного образца в образце (смешанного) заболевания
• Улучшенный вызов SNP и соматических мутаций относительно расчетной доли
Особенности
- Обнаружение соматических мутаций
- Образец вывода о примесях
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
Java
Категории
Это приложение, которое также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/virmid/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
