Это приложение для Windows с именем FUNseq, последний выпуск которого можно загрузить как ProcessStack2D.exe. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием FUNseq с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ
Ad
FUNseq
ОПИСАНИЕ
На этой странице показана программа сегментации/отслеживания ячеек для конвейера FUNseq.
Идентификация разреженного подмножества раковых клеток из большой гетерогенной популяции на основе агрессивных фенотипов (таких как инвазивная миграция, мультиполярные деления или асимметричное развитие клонов) является сложной задачей. Кроме того, идентификация такой аберрации имеет решающее значение, поскольку клетки, демонстрирующие эти характеристики, линейно коррелируют с плохим прогнозом. Наша группа разработала высокопроизводительный скрининговый микроскоп для захвата этих редких, аномальных раковых клеток. Необходима программа для точного и быстрого определения этих представляющих интерес клеток. Для этого мы разработали программу mTGMM, которая отслеживает клетки высокопроизводительных изображений и определяет агрессивные фенотипы.
Особенности
- Предварительная обработка изображений: мы предоставляем методы настройки качества для изображений с неоднородным профилем интенсивности флуоресценции между клетками.
- Параллельная сегментация ядер: мы использовали агломеративный водораздел для сегментации клеток.
- Отслеживание с использованием моделей Гаусса: профиль интенсивности ядра моделируется как двумерное распределение Гаусса. Отслеживание ядер выполняется путем пересылки каждого гауссова от момента времени t до (t + 2) с использованием байесовского вывода с априорным знанием того, что положение, форма и общая интенсивность ядер не могут резко измениться между двумя последовательными моментами времени.
- Извлечение признаков: это постанализ, в ходе которого мы создаем таблицу признаков с записями клеточной миграции, деления и внутриклеточной интенсивности.
- Визуализация данных: мы предоставляем опции для визуализации клеточных масок, траекторий миграции, деления клеток и обнаружения морфологии.
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/funseq/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
