Это приложение для Windows под названием Gen3D, последний выпуск которого можно загрузить как gen3d.cpp. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение Gen3D с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ
Ad
Gen3D
ОПИСАНИЕ
Gen3D - это приложение, предназначенное для определения трехмерных моделей генома и хромосом. Он использует хромосомные контактные данные для построения трехмерных конформаций. Этот метод позволяет генерировать трехмерные хромосомные модели, удовлетворяющие большую часть хромосомных контактов.
Программное обеспечение разработано в Лаборатории биоинформатики, интеллектуального анализа данных и машинного обучения профессора Цзяньлинь Ченга факультета компьютерных наук Университета Миссури - Колумбия, США. Проект поддержан Национальным научным фондом (грант DBI1149224).
Если вы используете Gen3D в своих исследованиях, процитируйте, пожалуйста:
Новотны, Джексон, Шариф Ахмед, Линфей Сюй, Олуватосин Олувадаре, Ханна Чен, Ноэлан Хенсли, Туан Триу, Ренжи Цао и Цзяньлинь Ченг. «Итеративная реконструкция трехмерных моделей хромосом человека по хромосомным контактным данным». BMC Bioinformatics 16, вып. 1 (2015): 338.
Особенности
- Использовать хромосомные контактные данные, полученные с помощью техники Hi-C
- Создание трехмерных структурных моделей генома и хромосом на основе данных о контактах хромосом.
- Инициализировать координаты с использованием вероятностного подхода
- Новый метод представления удовлетворенных контактов в матрице тепловой карты
- Схемы подсчета очков для определения контактов на дальние и ближние расстояния
- По сравнению с другими существующими методами, а также подтверждено с учетом особенностей генома
Аудитория
Наука / Исследования, Инженерия
Язык программирования
C + +
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/gen3d/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
