Это приложение для Windows с именем Javamony для запуска в Windows через Интернет через Linux, последний выпуск которого можно загрузить как Javamony.jar. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите в Интернете это приложение под названием Javamony, чтобы бесплатно запускать его в Windows в Интернете поверх Linux в Интернете с помощью OnWorks.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ
Ad
Javamony будет работать в Windows онлайн через Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
На основе не очень удачного Пизимония (https://sourceforge.net/projects/pysimony/), тот же решительный студент еще раз решает филогенетическую проблему.Джавамони вызывается следующим образом:
java -jar Javamony.jar [input.fasta] [случайный / пошаговый (начальное дерево)] [количество бутстрапов] [таксон внешней группы № 1] [таксон внешней группы № 2] ...
Не задумываясь как конкурентоспособная программа филогенетического вывода, Javamony - это возможность для меня овладеть языком Java, одновременно обучаясь обращению и решению фундаментальных проблем филогенетики. Поэтому, для моего личного образования, весь код является оригинальным. Конечно, ошибок тоже, наверное, немало.
Я распространяю Javamony, как и Pysimony, надеясь, что это будет полезно для обучения кого-то еще или, по крайней мере, немного забавно.
Предстоящие функции будут:
- Поддержка аминокислотных последовательностей
- Поддержка дополнительных форматов файлов (например, Nexus)
- Многопоточность
- Дополнительные методы оценки (например, максимальная вероятность)
Особенности
- Максимально бережливость
- Читает входной файл FASTA (только ДНК)
- Внешняя группа, созданная пользователем
- Стартовые деревья случайного и пошагового сложения
- Использует поиск по дереву SPR (обрезка и пересадка поддеревьев)
- Выполняет начальную загрузку
- Выводит стандартный формат Newick с поддержкой начальной загрузки и длинами ветвлений.
- Рисует окончательное дерево с поддержкой начальной загрузки
Аудитория
Наука / Исследования, Образование
Интерфейс пользователя
Командная строка
Язык программирования
Java
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/javamony/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
