Это приложение для Windows под названием MCPerm: перестановка SNP по методу Монте-Карло для работы в Windows в Интернете поверх Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как MCPerm_1.1.2.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием MCPerm: перестановка SNP Монте-Карло для запуска в Windows онлайн через Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
MCPerm: перестановка SNP Монте-Карло для запуска в Windows онлайн через Linux онлайн
Ad
ОПИСАНИЕ
MCPerm: метод перестановки Монте-Карло для множественной корреляции тестов в исследовании ассоциации случай-контрольТрадиционный тест перестановки (TradPerm) - важный метод непараметрического анализа, который можно рассматривать как золотой стандарт для множественных исправлений тестирования в исследовании ассоциации случай-контроль. Однако он полагается на данные генотипов и фенотипов исходного однонуклеотидного полиморфизма (SNP) для выполнения большого количества случайных перетасовок, и, таким образом, требует больших вычислительных ресурсов, особенно для исследования ассоциаций в масштабе всего генома (GWAS). Чтобы повысить скорость вычислений без изменения размера p-значения TradPerm, мы разработали метод перестановки Монте-Карло (MCPerm) в качестве эффективной альтернативы TradPerm.
Методы: MCPerm не нуждается в перетасовке исходных данных генотипов и фенотипов. Он использует метод Монте-Карло, использует двухэтапное гипергеометрическое распределение для генерации случайного числа генотипов (AA, Aa и aa) в случаях и контролях.
Язык программирования
B / R
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/mcperm/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.