Это приложение для Windows под названием sgRNAcas9, последний выпуск которого можно загрузить как sgRNAcas9_3.0.5.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием sgRNAcas9 с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ
Ad
sgRNAcas9
ОПИСАНИЕ
Этот пакет состоит из программ для выполнения поиска сайтов-мишеней CRISPR (протоспейсеров) с параметрами, определяемыми пользователем, прогнозирования потенциальных сайтов расщепления (POT) Cas9 по всему геному, классификации POT по трем категориям, олигонуклеотидов для конструирования 20 -nt (нуклеотиды) или векторы экспрессии усеченной sgRNA, извлекают нуклеотидные последовательности желаемой длины, фланкирующие сайты расщепления на или вне мишени, для конструирования пар праймеров ПЦР для подтверждения мутаций с помощью анализа расщепления T7E1. Важно отметить, что, идентифицируя потенциально нецелевые сайты in silico, sgRNAcas9 позволяет выбирать более конкретные целевые сайты и помогает идентифицировать настоящие нецелевые сайты, значительно облегчая дизайн sgRNA для приложений редактирования генома.Цитируется: Xie S, ShenB, Zhang C, Huang X, Zhang Y. sgRNAcas9: программный пакет для создания CRISPR sgRNA и оценки потенциальных сайтов расщепления вне мишени. PLoS One. 2014,9 (6): e100448.
http://www.biootools.com/
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/sgrnacas9/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
