Это приложение для Windows под названием Visualization of Protein-Ligand Graphs для запуска в Windows в Интернете поверх Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как vplg_2016_07_18.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Visualization of Protein-Ligand Graphs для бесплатного запуска в Windows онлайн поверх Linux онлайн с OnWorks.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ
Ad
Визуализация графов белок-лиганд для запуска в Windows онлайн поверх Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
Программный пакет визуализации белков-лигандов (VPLG) вычисляет и визуализирует графики белков. Он работает на уровне супервторичной структуры и использует координаты атомов из файлов PDB и назначения SSE алгоритма DSSP.VPLG - это программа командной строки. Если вам не нравится вводить команды, попробуйте наш веб-сервер PTGL: http://ptgl.uni-frankfurt.de/
Особенности
- Считывает трехмерные атомные данные из файлов PDB и назначения вторичной структуры из файлов DSSP
- Вычисляет график белок-лиганд на основе данных и визуализирует график
- Поддерживает вывод графических изображений в растровом (.png) и векторном (.svg) форматах.
- Экспортирует графики белок-лиганд в простой текстовый файл в собственном формате (.plg), который легко редактировать, анализировать и генерировать с помощью компьютерной программы, а также в ряде стандартных форматов файлов графиков.
- Может читать и напрямую визуализировать белковые графики из файлов .plg
- Бесплатное программное обеспечение с открытым исходным кодом (FOSS)
- Поддержка базы данных (совершенно необязательно, сервер базы данных по умолчанию не требуется)
- Интерфейс командной строки позволяет легко выполнять пакетную обработку с помощью сценариев оболочки.
- Позволяет фильтровать лиганды по номеру атома
- Новый графический интерфейс, написанный на Java, больше не нужно вводить консольные команды!
- Программное обеспечение, на котором работает веб-сервер PTGL: http://ptgl.uni-frankfurt.de/
Аудитория
Наука / исследования, образование, продвинутые конечные пользователи
Интерфейс пользователя
Java Swing, консоль / терминал, командная строка
Язык программирования
Java
Среда базы данных
JDBC
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/vplg/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
