นี่คือคำสั่ง altree-convertp ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
altree-convert - ชื่อเรื่อง...
เรื่องย่อ
altree-แปลง [ตัวเลือก]
ตัวเลือก:
--รุ่นโปรแกรมรุ่น
--short-help|h ข้อความช่วยเหลือสั้นๆ
--help ข้อความช่วยเหลือพร้อมคำอธิบายตัวเลือก
--man เอกสารฉบับเต็ม
--first-input-file|i ใส่ไฟล์ 1
--second-input-file|j ไฟล์อินพุต 2 (ไม่จำเป็น)
--output-file|o ไฟล์เอาท์พุต
--case-control-output|c เอาต์พุตที่มี nb case/controls
--ประเภทข้อมูล|t DNA|NUM
--phylo-prog|p PAUP|PHYLIP
--สร้างใหม่-prog|r เฟส|FAMHAP
--data-quali|q ประเภทของข้อมูล: เชิงคุณภาพหรือเชิงปริมาณ
--nbind-threshold|s จำนวนบุคคลขั้นต่ำที่ได้รับเพื่อรักษา haplotype
OPTIONS
--รุ่น
พิมพ์เวอร์ชันของโปรแกรมและออก
--สั้นช่วย
พิมพ์ข้อความช่วยเหลือสั้นๆ และออก
--ช่วยด้วย พิมพ์ข้อความช่วยเหลือพร้อมคำอธิบายตัวเลือกและการออก
--ชาย พิมพ์หน้าคู่มือและออก
--ไฟล์อินพุตแรก|i
ไฟล์อินพุต 1 (เอาต์พุตของโปรแกรมสร้างใหม่)
--วินาทีอินพุตไฟล์|ญ
ไฟล์อินพุต 2 (เอาต์พุตที่สองของ famhap หรือไฟล์ที่มีสถานะโรค)
--เอาท์พุทไฟล์|o
ไฟล์เอาต์พุต
--case-control-output|ค
ไฟล์เอาท์พุตที่มีจำนวนเคสและส่วนควบคุมที่มีแฮพโลไทป์แต่ละอัน
--ประเภทข้อมูล|t "DNA"|"SNP"
ประเภทข้อมูล: DNA (ATGCU) หรือ SNP (0-1)
--ไฟโล-โปรก|หน้า "ฟิลลิป"|"โป้"
โปรแกรมฟื้นฟูสายวิวัฒนาการ
สร้างใหม่-prog|r "แฟมฮับ|เฟส"
โครงการฟื้นฟู Haplotype
ข้อมูลที่มีคุณภาพ|q "เชิงคุณภาพ|เชิงปริมาณ"
ประเภทของข้อมูลที่วิเคราะห์
nbind เกณฑ์ | s
จำนวนบุคคลที่ถือฮาโพลไทป์น้อยที่สุดที่จำเป็นต้องเก็บไว้
การวิเคราะห์เพิ่มเติม หากคุณต้องการเก็บ haplotypes ทั้งหมด คุณต้องมีผลกับ 0 ต่อสิ่งนี้
ตัวแปร
DESCRIPTION
โครงการ จะอ่านไฟล์อินพุตที่กำหนดและสร้างไฟล์อินพุตสำหรับ
ซอฟต์แวร์สร้างสายวิวัฒนาการใหม่ paup หรือ phylip/paml
ใช้ altree-convertp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net