นี่คือคำสั่ง arden-analyze ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
arden-analyze - วิเคราะห์ผลลัพธ์ของการทำแผนที่จีโนมอ้างอิงเทียม
เรื่องย่อ
arden-วิเคราะห์ [ตัวเลือก] [INPUT ไฟล์] [OUTPUTOLDER-
DESCRIPTION
สคริปต์เพื่อวิเคราะห์ผลลัพธ์ของการทำแผนที่จีโนมอ้างอิงเทียม สคริปต์นี้
ระบุ TPs / FP สมมุติในชุดข้อมูลเฉพาะ (อ่าน)
OPTIONS
OUTPUTOLDER
เส้นทางไปยังโฟลเดอร์ปลายทางที่ส่งออก
INPUT ไฟล์
ppath ไปยังไฟล์ ini เพื่อให้ได้รูปแบบที่ต้องการ ให้ดูที่ไฟล์ตัวอย่าง
--รุ่น
แสดงหมายเลขเวอร์ชันของโปรแกรมและออก
-h, --ช่วยด้วย
แสดงข้อความช่วยเหลือนี้และออก
-p พีรด, --เฟร็ด=เพรด
ระบุการเข้ารหัส PHRED ของอินพุตที่อ่านเช่น Illumina 1.3+ = -p 33.[ค่าเริ่มต้น:
33]
-r อันดับ --อันดับภายใน=RANK
ใช้การจัดอันดับภายในสำหรับการอ่าน (จำเป็นหากไม่สามารถอ่านชื่อได้
เรียงศัพท์ด้วยวิธีเดียวกันใน python และ OS ของคุณโดย sam
เครื่องมือ).[ค่าเริ่มต้น:1]
ใช้ arden วิเคราะห์ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
