chemtool - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

chemtool - ตัวแก้ไขโครงสร้างทางเคมี

เรื่องย่อ

เครื่องมือเคมี [ชื่อไฟล์]

DESCRIPTION

เครื่องมือเคมี เป็นโปรแกรมสำหรับวาดโมเลกุลอินทรีย์และส่งออกเป็นบิตแมป X, PNG,
ไฟล์ PicTeX, Xfig, SVG, SXD, MDL หรือ EPS มันทำงานภายใต้ระบบ X Window โดยใช้ GTK
ชุดวิดเจ็ต

โปรแกรมเสนอการเลิกทำ/ทำซ้ำได้ไม่จำกัด โดยพื้นฐานแล้ว แบบอักษรข้อความสองแบบพร้อมสัญลักษณ์ เจ็ด
สี การวาดด้วยมาตราส่วนการซูมหลายระดับ และตารางฉากหลังแบบสี่เหลี่ยมและหกเหลี่ยมเพื่อให้ง่ายขึ้น
การจัดตำแหน่ง

ตัวอย่าง

ในโหมดการวาดภาพและการแก้ไขทั้งหมด ปุ่มเมาส์หนึ่งปุ่ม (โดยปกติคือปุ่มซ้าย) จะถูกใช้เพื่อ
ทำเครื่องหมายหรือวาดวัตถุ ในขณะที่ปุ่มสาม (ปุ่มขวา) สามารถใช้เพื่อลบวัตถุได้
ของประเภทปัจจุบัน ปุ่มกลางส่วนใหญ่จะใช้ในโหมดการวาดพันธบัตรที่มัน
ช่วยให้เปลี่ยนประเภทพันธะได้อย่างรวดเร็ว เริ่มต้นด้วยเวอร์ชัน 1.5 ที่เก็บข้อมูลเริ่มต้น
ไดเร็กทอรีสำหรับ datafiles และนามสกุลไฟล์ที่จะใช้สามารถบันทึกได้ผ่าน a
กล่องโต้ตอบการกำหนดค่า

การวาดภาพ of พันธบัตร:
สามารถวาดพันธะในการตั้งค่ามุมที่แตกต่างกัน 4 แบบ (หกเหลี่ยมที่มีช่วง 30°, สอง
รูปห้าเหลี่ยมที่มีช่วง 72° (การวางแนวต่างกัน) และรูปแปดเหลี่ยม 45° i) (ระดับกลาง
มุมสามารถทำได้ในโหมดเหล่านี้ทั้งหมดเช่นกัน - เพียงแค่ละเว้นจุดเครื่องหมายในนี้
กรณี).

ตัวเลือกรูปแบบการประสานที่อยู่ตรงกลางของแถบปุ่มจะกำหนดประเภทของการยึดเกาะที่เป็น
วาด - ในขั้นต้นนี่คือพันธะเดียว หากคุณต้องการเปลี่ยนประเภทของพันธบัตรในภายหลัง
คลิกที่ปุ่มตรงกลางของเมาส์เพื่อไปยังประเภทถัดไปหรือ
เลือกประเภทที่เหมาะสมในตัวเลือก จากนั้นสลับเป็นโหมดประเภทพันธะแล้วเลือกทั้งหมด
พันธบัตรที่คุณต้องการเปลี่ยนเป็นชนิดใหม่ (สีที่ใช้สำหรับพันธบัตรคือ
อัปเดตในเวลาเดียวกันหากจำเป็น) กดปุ่มกลางของเมาส์บนพันธะเมื่ออยู่ใน
โหมด 'Bondtype' จะกลับทิศทางของพันธะนั้น

การใช้ปุ่มที่สาม (โดยปกติคือปุ่มขวา) ของเมาส์จะลบพันธะที่อยู่ถัดจากเคอร์เซอร์
ตำแหน่ง

ประเภทพันธบัตรที่มีอยู่คือ:

· พันธะเดี่ยว

· พันธะคู่

· พันธะคู่ (ด้านที่สั้นกว่า)

· พันธะคู่ที่มีศูนย์กลาง

· พันธะสาม (เส้นขนาบสั้นกว่าศูนย์กลาง)

· พันธะสาม (ที่มีความยาวเส้นเท่ากัน)

· พันธะสี่เท่า

· พันธะรูปลิ่ม

· พันธะรูปลิ่มประ

· เส้นหยัก

· ลูกธนูครึ่งลูก

· ลูกศรธรรมดา

· พันธะกว้าง

· วงกลม

· จุดไข่ปลา

· พันธะเดี่ยวที่ทับซ้อนกัน (ซึ่งตัดส่วนออกจากพันธะใดๆ ที่ข้าม)

· กลีบโคจรแสง

· pi มืด orbital lobe

ครึ่งอัตโนมัติ การวาดภาพ of แหวน:
สามารถวาดวงแหวนของสมาชิก 3 ถึง 12 คนได้อย่างง่ายดายโดยกดปุ่ม Ctrl ค้างไว้ขณะวาด
ไลน์. เส้นนี้จะกลายเป็นส่วนแรกของวงแหวนที่วาดโดยอัตโนมัติ
ในทิศทางตามเข็มนาฬิกา ขนาดของแหวนเริ่มต้นตามความเหมาะสมสำหรับการเลือก
โหมดการวาด (เช่น 5, 6 หรือ 8 ด้าน) แต่สามารถตั้งค่าแบบต่อแหวนได้โดยการกด
Ctlr- ก่อนวาดแหวน โดยที่ตัวเลข 3-9 ตรงกับ 3 ถึง 9 สมาชิก
แหวน ในขณะที่ 0 ถึง 2 เลือกแหวน 10, 11 และ 12 สมาชิกตามลำดับ

วงแหวนที่วาดใหม่สามารถลบได้โดยกด Ctrl และปุ่มเมาส์ 3 พร้อมกัน

การวาดภาพ of โค้ง บรรทัด:
เส้นโค้งสำหรับวัตถุ เช่น ลูกศร หรือ กลีบโคจร สามารถวาดในโหมดเส้นโค้งเส้นโค้งโดย
ระบุจุดควบคุมสี่จุดที่สร้างรูปหลายเหลี่ยมที่มีขอบเขต (จุดเริ่มต้น สองจุดบน
ด้านใดด้านหนึ่งของพีค จุดปลาย) จากประเภทพันธบัตรปกติที่มีอยู่ในเมนูรูปแบบ
'เส้นเดียว', 'ครึ่งลูกศร', ลูกศร และ 'เส้นประ' ยังคงทำหน้าที่ตามปกติในขณะที่
ประเภท 'เส้นกว้าง' ใช้เพื่อแสดงถึงรูปหลายเหลี่ยมที่เติม จุดควบคุมเท่านั้น
ปรากฏใน ย้าย โหมดที่สามารถลากไปมาเพื่อเปลี่ยนรูปแบบของเส้นโค้งได้ภายหลัง
มันถูกวาด

การตั้งค่า พันธบัตร สไตล์
ในโหมดรูปแบบพันธะ การคลิกที่พันธะใดๆ ในไดอะแกรมจะเปลี่ยนการแสดงเป็น
ประเภทที่เลือกในเมนูแบบเลื่อนลงถัดจาก ชนิดภาพเขียน ปุ่ม

ประเภทพันธบัตรเพิ่มเติมที่มีอยู่ในเมนูแบบเลื่อนลง

ลูกศรโค้ง

ใช้ได้เฉพาะการวาดเท่านั้น อันที่จริงมันเป็นทางลัดสำหรับการวาดเส้นโค้งอันใดอันหนึ่ง
ฟังก์ชั่นที่อธิบายไว้ข้างต้นโดยมีจุดควบคุมที่สองและสามโดยอัตโนมัติ
สร้างขึ้น ด้วยเหตุนี้จึงไม่สามารถแปลงเป็นหรือจากประเภทบอนด์ทั่วไปได้

(อย่างไรก็ตาม แปลงเป็นเส้นโค้งประเภทอื่นๆ ได้ เช่น เปลี่ยนประเภท
หัวลูกศร). ปกติต้องปรับรูปร่างของลูกศรโดยเลื่อนปุ่ม
จุดควบคุมที่ปรากฏควบคู่ไปกับมันในโหมด 'ย้าย'

แทรก ข้อความ
ข้อความที่เขียนลงในกล่องข้อความสามารถวางตำแหน่งด้วยเคอร์เซอร์และอาจปรากฏทางซ้าย
กึ่งกลางหรือชิดขวาในภาพวาด ขนาดและสีของข้อความสามารถเลือกได้จากค่าคงที่
รายการตัวเลือก มีอักขระพิเศษสองตัวที่ใช้สำหรับตัวย่อและตัวยก
อักขระต่อไปนี้:

'^' เพื่อเลื่อนขึ้น (เช่น N^+)

'_' เพื่อเลื่อนลง (เช่น CH_3)

อักขระควบคุม '|' ใช้เพื่อทำให้อักขระต่อไปนี้เป็นตัวเอียง เช่นใน |t-Bu

แบบฟอนต์ตัวหนา โดยทั่วไปจะใช้สำหรับการนับเลขผสม สามารถเลือกได้โดยการนำหน้า
อักขระที่มี '#'

อักขระพิเศษ '@' เปลี่ยนเป็นโหมดสัญลักษณ์ ซึ่งใช้สัญลักษณ์ X11 มาตรฐาน
แบบอักษร ปุ่มตัวอักษรทั้งหมดจะสร้างอักขระกรีกที่สอดคล้องกันในโหมดนี้และ
มีสัญลักษณ์อื่นๆ อีกหลายตัวหากเทียบเท่ากับ Latin1 มาตรฐานอยู่แล้ว
แมปบนแป้นพิมพ์:

เยน -> อินฟินิตี้

ยัติภังค์ -> uparrow

มาครง -> ลูกศรชี้ลง

สัญลักษณ์ 'plusminus' และ 'registered' (เครื่องหมายการค้า) มีอยู่แล้วในแบบอักษรมาตรฐาน
แม้ว่าปกติจะไม่สามารถใช้ได้บนแป้นพิมพ์ก็ตาม ใช้คำสั่งต่อไปนี้ (หรือ
เพิ่มการประกาศของคุณ .xmodmaprc ) เพื่อให้สามารถใช้งานได้ผ่าน +
( + ):

xmodmap -e 'keysym r = r R ลงทะเบียนแล้ว' \
-e 'keysym o = o O เยน' \
-e 'keysym p = p P บวกลบ' \
-e 'keysym u = u คุณยัติภังค์' \
-e 'keysym d = d D มาครง'

(สิ่งนี้นำไปสู่ ​​AltGr-P = plusminus, AltGr-R = ลงทะเบียนในโหมดปกติและ AltGr-O =
อินฟินิตี้, AltGr-U = ลูกศรขึ้น, AltGr-D = ลูกศรชี้ลงในแบบอักษรสัญลักษณ์)

สำหรับไดอะแกรม 'dots-and-crosses' การแมปต่อไปนี้กับแบบอักษรสัญลักษณ์อาจเป็น
มีประโยชน์: เฉียบพลัน -> กากบาท (เช่น keysym x = x X เฉียบพลัน) จุดกลาง -> จุดที่เติม (เช่น keysym
d = d D periodcentered) (ใช้เครื่องหมายองศาสำหรับจุดเปิด)

เครื่องหมายบวกและลบแบบวงกลมสำหรับแสดงประจุไอออนิกมีอยู่ใน @+
และ @- .

เมื่อคุณต้องการใช้สัญลักษณ์เป็นตัวห้อยหรือตัวยก ให้วางตัวห้อยหรือตัวยก
อักขระก่อนอักขระ '@' เช่น K_@a

ในโหมดข้อความ ปุ่มเมาส์ขวาจะลบป้ายกำกับที่ตำแหน่งเคอร์เซอร์ การเปลี่ยนแปลง
ขนาด แบบอักษร หรือสีของฉลากสามารถทำได้โดยคลิกซ้ายที่ฉลากหลังจากเลือก
การรวมกันของการตั้งค่าที่ต้องการ เมื่อช่องป้อนข้อความด้านบนพื้นที่วาดภาพว่างเปล่า
เฉพาะการตั้งค่าเท่านั้นที่ได้รับการอัปเดตโดยไม่เปลี่ยนเนื้อหาของฉลาก มิฉะนั้น
ข้อความป้ายกำกับก็ถูกแทนที่ด้วย หากคุณต้องการคัดลอกข้อความของฉลากที่มีอยู่ไปยัง
ช่องป้อนข้อความ ให้คลิกที่ปุ่มกลางของเมาส์

การติดฉลาก ทางลัด
ในโหมดการวาดพันธะทั้งหมด มีแป้นพิมพ์ลัดหลายปุ่มเพื่อเพิ่มสัญลักษณ์อะตอม
โดยไม่ต้องออกจากโหมดการวาดภาพ ป้ายถูกวางไว้ที่ตำแหน่งการวาดปัจจุบัน
(จุดสิ้นสุดของบรรทัดสุดท้ายที่วาด หรือจุดที่คลิกล่าสุด)

คีย์ 'c', 'h', 'n', 'o','s', 'p' และ 'r' แทรกตัวพิมพ์ใหญ่ที่สอดคล้องกัน 'l'
(L ตัวพิมพ์เล็ก) แทรก 'Cl' ในขณะที่ '1', '2', '3' ใส่ CH,CH_2 และ CH_3 ตามลำดับ NS
แป้นดอกจัน (*) แทรกวงกลมที่เติม

การกดแป้นเว้นวรรคหนึ่งครั้งจะทำให้คุณสามารถป้อนป้ายกำกับตามอำเภอใจซึ่งจะถูกวางไว้ที่
ตำแหน่งปัจจุบันเมื่อคุณกดปุ่ม Return

การวาดภาพ อิเล็กตรอน คู่
แป้นของแป้นตัวเลขสามารถใช้เพื่อวาดเส้น 'คู่อิเล็กตรอน' สั้น ๆ ถัดจาก an
สัญลักษณ์องค์ประกอบ - หากใครนึกภาพสัญลักษณ์องค์ประกอบที่จะนั่งบนปุ่ม '5' ตรงกลาง
แต่ละคีย์จะดึงคู่อิเล็กตรอนที่เหมาะสมสำหรับตำแหน่งของมัน เมื่อใช้ร่วมกับ
ปุ่ม Shift วาดจุดสองจุดแทนเส้น - เพียงแค่ลบจุดหนึ่งอีกครั้งหาก
คุณต้องมีอิเล็กตรอนเป็นจำนวนคี่

การนับ อะตอม
สำหรับการนับอะตอมในโมเลกุลอย่างรวดเร็ว ให้เปลี่ยนไปใช้โหมดข้อความอย่างใดอย่างหนึ่ง กด
ปุ่มควบคุมและเลือกแต่ละอะตอมตามลำดับด้วยปุ่มซ้ายของเมาส์ การนับ
เริ่มต้นที่ 1 และสามารถรีเซ็ตลำดับได้ตลอดเวลาโดยคลิกปุ่มขวาของเมาส์
หากคุณต้องการใช้รูปแบบการนับของคุณเอง ให้คลิกปุ่มกลาง (ในขณะที่ยังคง
กดปุ่ม Control ค้างไว้) ทำให้หยิบหมายเลขใดก็ได้ในช่องป้อนข้อความ

อยู่ตรงกลาง
หากมีพื้นที่ไม่เพียงพอสำหรับโมเลกุลของคุณ คุณสามารถวางไว้ตรงกลางแผ่น
ด้วยปุ่มตรงกลาง

การส่งออก ไปยัง ต่างประเทศ รูปแบบ:
คุณสามารถส่งออกโมเลกุลของคุณเป็น X บิตแมป, ภาพ PNG หรือ EMF, การห่อหุ้ม
ไฟล์ postscript ไฟล์อินพุตสำหรับ Brian Smith' xfig(1) โปรแกรม MDL ver. 2000 โมลไฟล์
สำหรับการแลกเปลี่ยนข้อมูลกับแพ็คเกจเชิงพาณิชย์ ไฟล์ SVG สำหรับหน้าเว็บ XHTML หรือใน
รูปแบบ PicTeX สำหรับการรวมโดยตรงในเอกสาร LaTeX PicTeX, PNG, EMF และ
ฟังก์ชันเอาต์พุต Postscript ขึ้นอยู่กับ รูปที่2dev81) โปรแกรมจาก แปลงร่าง(1) แพ็คเกจ
และใช้ได้เฉพาะเมื่อตรวจพบโปรแกรมนี้เมื่อเริ่มต้นระบบ ถ้า ฟิก2sxd(1)
ติดตั้งโปรแกรมแล้ว มีตัวเลือกการส่งออกเพิ่มเติมสำหรับรูปแบบ OpenOffice SXD
ในทำนองเดียวกัน หากติดตั้งโปรแกรมบาเบล (เปิด) เมนูส่งออกเพิ่มเติมจะมีให้
สามารถเข้าถึงไฟล์ทุกประเภทที่เครื่องมือนี้รองรับได้

คุณสามารถสร้างเอาต์พุตในขนาดต่างๆ ตามมาตราส่วนการซูมปัจจุบัน
ไฟล์ Postscript และ PicTeX สามารถสร้างได้ตามมาตราส่วนที่เลือกได้บน
เมนูไฟล์ส่งออก

สามารถตั้งค่าตัวเลือกในเมนูกำหนดค่าเป็น call . ได้ รูปที่2dev เป็นภาษาสากล
โหมดซึ่งจะแสดงข้อความใด ๆ ที่เขียนในแบบอักษรสำรอง (ครั้ง) โดยอัตโนมัติโดยใช้
แบบอักษร postscript ที่เหมาะสมกับสถานที่ปัจจุบัน (ปัจจุบันเป็นภาษาโครเอเชีย ซิริลลิก
เช็ก, ฮังการี, ญี่ปุ่น, เกาหลี, โปแลนด์) ดู รูปที่2dev เอกสารสำหรับรายละเอียด

หากต้องการรวมไฟล์ PicTeX ไว้ในเอกสาร LaTeX คุณจะต้องมีแพ็คเกจมาโคร pictex
คุณอาจต้องโหลดแพ็คเกจ 'สี' ใน . ทั้งนี้ขึ้นอยู่กับเวอร์ชันที่คุณใช้
คำนำของไฟล์ LaTeX ของคุณ หากคุณพบข้อความแสดงข้อผิดพลาด "เกินความจุ TeX"
เพิ่มพารามิเตอร์ extra_mem_bot ใน your texmf.cnf ไฟล์ (โดยปกติใน
/usr/share/texmf/web2c, /usr/local/texmf or /etc/textmf). Pictex ขึ้นชื่อเรื่องความแปลกตา
ข้อกำหนดหน่วยความจำ (ตามมาตรฐาน tex) และการตั้งค่ามาตรฐานไม่ได้คำนึงถึงสิ่งนี้
(แม้ว่าคุณอาจพบความคิดเห็น a la 'เปลี่ยนสิ่งนี้ ถ้าคุณใช้ pictex' ในการ texmf.cnf
ไฟล์). บางอย่างเช่น extra_mem_bot=400000 ไม่ควรทำร้ายกับความทันสมัยระดับปานกลาง
ระบบ

การพิมพ์ ภาพวาด
ตั้งแต่เวอร์ชัน 1.5 การพิมพ์ไดอะแกรมโดยตรงไปยังอุปกรณ์การพิมพ์ที่รองรับ Postscript (หรือ
โดยทั่วไปแล้วคิวการพิมพ์ที่รัน ghostscript) เป็นไปได้มากกว่า ขนาดกระดาษ,
กำลังขยาย ชื่อเครื่องพิมพ์ และคำสั่งพิมพ์ที่จะใช้ (ปัจจุบันคือ lp(1) LPR(1)
or เครื่องพิมพ์(1)) สามารถเก็บไว้ในไดอะล็อกการกำหนดค่า

การเลือก ทั้งหมด or ส่วน of a การวาดภาพ for การเปลี่ยนแปลง:
การใช้ปุ่ม 'ทำเครื่องหมาย' คุณสามารถเลือกส่วนต่าง ๆ ของภาพวาดปัจจุบันโดยการปิดล้อม
ด้วยสี่เหลี่ยม 'ยางรัด'

หากคุณต้องการเพิ่มอะตอมนอกพื้นที่สี่เหลี่ยมลงในส่วนที่เลือก ให้วาด
ยางรัดอีกอันรอบตัวพวกเขาในขณะที่กดปุ่ม Ctrl ค้างไว้

ส่วนที่เลือกจะปรากฏเป็นสีน้ำเงินและพร้อมใช้งานทันทีสำหรับ

การย้าย เพียงลากชิ้นส่วนไปยังตำแหน่งที่ต้องการด้วยเมาส์ขณะกดค้างไว้
ลงปุ่มซ้ายของเมาส์ (ถ้าคุณต้องการย้ายอะตอมแต่ละอะตอมหรือ
คุณสามารถเลือกและลากในโหมด 'ย้าย' โดยไม่ต้องทำเครื่องหมาย
ก่อน)

หมุน การเคลื่อนที่ในแนวนอนของเมาส์แปลว่าการหมุนรอบ ๆ อย่างราบรื่น
จุดหมุนที่เลือกเมื่อกดปุ่มเมาส์

พลิก (มิเรอร์) ส่วนที่เกี่ยวกับระนาบกระจกแนวนอนหรือแนวตั้งผ่าน
ศูนย์กลางของมัน: ทำได้โดยคลิกที่ปุ่มเมนูที่เหมาะสม

การทำสำเนา คลิกที่ปุ่มเมนู 'คัดลอก' จะสร้างสำเนาที่ถูกต้องของรายการที่เลือก
แฟรกเมนต์ออฟเซ็ตเล็กน้อยกับต้นฉบับ เครื่องหมายเป็นไปโดยอัตโนมัติ
โอนไปยังสำเนาใหม่

กำลังขยาย การเคลื่อนไหวของเมาส์ในแนวนอนแปลเป็นการเพิ่มขึ้นหรือลดลงอย่างราบรื่นของ
ขนาดของชิ้นส่วนที่ทำเครื่องหมายไว้

ลบ หากต้องการลบส่วนที่ทำเครื่องหมายไว้ เพียงคลิกที่ส่วนที่สาม (ปกติจะอยู่ทางขวา)
ปุ่มเมาส์หลังจากที่ถูกเน้น

กรอบ เลือกหนึ่งในไอคอนจากรายการแบบหล่นลงของรูปแบบเฟรมและวงเล็บ
ดึงวัตถุที่เกี่ยวข้อง เช่น วงเล็บกลม รอบๆ
ส่วนที่เน้น

การเพิ่มประสิทธิภาพ คลิกที่สัญลักษณ์ 'ถังและไม้กวาด' เรียกใช้ฟังก์ชันที่ลบ
ทับซ้อนกัน (ซ้ำ) พันธะและฉลากจากการวาดและยืด
เส้นที่เกือบจะเป็นแนวนอนหรือแนวตั้ง

เพิ่ม ก่อนหน้านี้ ที่บันทึกไว้ ตัวเลข:
หากต้องการเพิ่มโมเลกุลอื่นจากภาพวาด chemtool ที่บันทึกไว้ก่อนหน้านี้ ให้เลือกในไฟล์
หน้าต่างการเลือกที่ปรากฏขึ้นเมื่อคุณกดปุ่ม 'เพิ่ม' คลิกเพียงครั้งเดียวบนใดๆ
ชื่อไฟล์ในรายการจะแสดงตัวอย่างเล็กๆ ของโมเลกุลเพื่อช่วยในการเลือก NS
โมเลกุลที่เพิ่มใหม่จะถูกเปิดใช้งานโดยอัตโนมัติเพื่อให้สามารถจัดตำแหน่งใหม่เป็น
ต้องการ

หากคุณต้องการเพิ่มไปยังตำแหน่งที่กำหนดไว้ล่วงหน้าของโมเลกุลอื่น คุณสามารถทำเครื่องหมายว่า
ไซต์สิ่งที่แนบมาโดยคลิกซ้ายที่ไฟล์แทนการลากสี่เหลี่ยมเครื่องหมาย ที่มีขนาดเล็ก
จุดสีเขียวจะปรากฏขึ้นที่ตำแหน่งอ้างอิงสำหรับส่วนใหม่ในขณะนี้ หากคุณบันทึก
โมเลกุลด้วยชุดเครื่องหมายดังกล่าว มันก็จะกำหนดตำแหน่งที่แนบมาของพวกมันเมื่อพวกมัน
ถูกเพิ่มไปยังภาพวาดอื่น

เพิ่ม หนึ่ง of ที่กำหนดไว้ล่วงหน้า แม่แบบ:
การเลือก 'เทมเพลต' จากเมนู 'เครื่องมือ' จะเปิดหน้าต่างที่สองพร้อมกับคอลเล็กชันขนาดเล็ก
ของโครงสร้างที่กำหนดไว้ล่วงหน้า เพียงคลิกที่ภาพของโมเลกุลที่ต้องการเพื่อเพิ่มลงใน
รูปวาดของคุณ สามารถเปิดหน้าต่างเทมเพลตไว้ได้ตลอดเซสชั่น chemtool - หากเป็น
ถูกซ่อนไว้โดยหน้าต่างอื่น คุณสามารถย้ายไปไว้ด้านหน้าโดยเลือกเมนู 'แม่แบบ'
ใน chemtool อีกครั้ง

ข้อมูลในระบบแม่แบบแตกต่างจากแบบเขียนเครื่องมือเคมีทั่วไปเพียงเพราะว่า
พวกเขาจะถูกเก็บไว้ในโปรแกรมและในรูปแบบที่น่าอึดอัดใจเล็กน้อย (พิกัด x และ y
ระบุไว้แยกต่างหากในไฟล์ต้นฉบับ templates.h) สิ่งเหล่านี้มีขึ้นเพื่อให้
ชุดพื้นฐานที่สะดวกสำหรับผู้ใช้ทุกคน แต่ไม่สามารถขยายทีละรายการได้ (คุณสามารถใช้
ฟังก์ชัน 'เพิ่ม' สำหรับโครงสร้างของคุณเอง) โปรดแจ้งให้เราทราบหากคุณต้องการเฉพาะ
เพิ่มโมเลกุลลงในเทมเพลต - ชื่อหรือไฟล์รูปวาด chemtool ปกติ
คือสิ่งที่เราต้องการ (ส่งอีเมล์ไปที่ [ป้องกันอีเมล])

การนำเข้า ต่างประเทศ ไฟล์ รูปแบบ:
Chemtool จัดเตรียมฟังก์ชันสำหรับการนำเข้าไฟล์ทั้งในรูปแบบ PDB ที่ใช้โดย Protein
ฐานข้อมูล (และโดยแพ็คเกจการสร้างแบบจำลองโมเลกุลส่วนใหญ่) และรูปแบบ MDL molfile ที่เป็นกรรมสิทธิ์
ใช้โดย ISISdraw และเข้าใจโดยแพ็คเกจการวาดโครงสร้างและฐานข้อมูลอื่น ๆ
ส่วนหน้า

เนื่องจากทั้งคู่เป็นรูปแบบไฟล์ 3D ในขณะที่ chemtool จัดการเฉพาะการฉายภาพ 2D นำเข้า
โมเลกุลจะถูกอ่านในที่จัดเก็บชั่วคราวในตอนแรกและแสดงเป็นสีน้ำเงินบนผืนผ้าใบ
การแสดงภาพ 3 มิตินี้สามารถหมุนได้โดยใช้เมาส์ หลังจากกด Return . เท่านั้น
คีย์บนแป้นพิมพ์จะถูกแปลงเป็นการฉายภาพ 2D สุดท้ายที่สามารถแก้ไขได้ ในขณะที่
กำลังดำเนินการนำเข้า 3 มิติ ฟังก์ชันการวาดภาพและการแก้ไขปกติทั้งหมดจะถูกปิดใช้งาน

ด้วยการนำเข้า MDL molfile ฉลากอะตอมของคาร์บอนจะถูกละทิ้งโดยอัตโนมัติ สำหรับ PDB
นำเข้าจำนวนการติดฉลากสามารถเลือกได้ในกล่องโต้ตอบการเลือกไฟล์ซึ่งมี
การเก็บรักษาฉลากทั้งหมด เฉพาะของอะตอมที่ไม่ใช่ไฮโดรเจน หรือเฉพาะที่ไม่ใช่ตัวเลข
ส่วนหนึ่งของฉลาก

หากติดตั้งโปรแกรม Babel - เวอร์ชันดั้งเดิมที่เขียนโดย Pat Walters หรือ
ความพยายามล่าสุดของ OpenBabel - chemtool จะเสนอตัวเลือกเมนูสำหรับ .โดยอัตโนมัติ
นำเข้าจากรูปแบบไฟล์ใด ๆ ที่สนับสนุน

การกำหนด รวม สูตร และ โมเลกุล น้ำหนัก:
การแจกจ่ายประกอบด้วยโปรแกรมตัวช่วย CHT(1) โดย Radek Liboska (ปราก) เพื่อคำนวณ
สูตรผลรวมและน้ำหนักโมเลกุล (ที่แน่นอน) จากไฟล์รูปวาด chemtool ยังเป็น
ได้จากภายใน chemtool เพื่อคำนวณข้อมูลเหล่านี้สำหรับโครงสร้างปัจจุบันหรือ a
ทำเครื่องหมายส่วนของมัน CHT อาจถูกเข้าใจผิดโดยพันธะที่ซ้ำกัน ( chemtool ไม่ลบ
พันธะที่ทับซ้อนกัน เช่น อาจเป็นผลมาจากระบบวงแหวนหลอมรวมโดยอัตโนมัติ) และ
ด้วยสัญลักษณ์ 'แหวนหอม' ดังนั้นคุณควรหลีกเลี่ยงสิ่งเหล่านี้และตรวจสอบความเป็นไปได้ของ
สร้างสูตรผลรวมที่เป็นไปได้

การวาดภาพ ฟังก์ชั่น ไม่ ใช้ได้ ภายใน เครื่องมือเคมี:
สำหรับฟีเจอร์ที่ chemtool ไม่รองรับในปัจจุบัน เช่น ฟังก์ชันการวาดเส้นทั่วไป
รับแพ็คเกจวาดรูป XFig ของ Brian Smith xfig ขอแนะนำอย่างยิ่ง เกี่ยวกับ เท่านั้น
สิ่งที่ไม่มีให้คือการสนับสนุนสำหรับประเภทสาย 'เคมี' และมุมการวาด - ซึ่งก็คือ
เหตุใด chemtool จึงถูกเขียนขึ้นเป็นโปรแกรมร่วม (คงจะมีมากกว่า
ตัวเลือกการวาดภาพที่จำเป็นที่สุดที่เพิ่มเข้ามาใน chemtool เมื่อเวลาผ่านไป แต่มีการทำซ้ำ
คุณสมบัติวัตถุประสงค์ทั่วไปเพิ่มเติมของ xfig ดูเหมือนไร้สาระมาก)

ใช้ chemtool ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net