นี่คือคำสั่ง cmtk ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
cmtk - ชุดเครื่องมือคำนวณสัณฐานวิทยา
เรื่องย่อ
ซม [ตัวเลือก]
DESCRIPTION
สคริปต์ตัวช่วยนี้จัดเตรียมการเข้าถึงแบบรวมสำหรับเครื่องมือบรรทัดคำสั่งทั้งหมดที่มีให้โดย CMTK
โปรดระบุคำสั่งของ CMTK เพื่อเรียกใช้และตัวเลือก ดู cmtk- (1) manpage หรือ
เอาต์พุตของ ซม --ช่วยด้วย สำหรับ ตัวเลือกเฉพาะ
คำสั่ง
การแบ่งส่วน
ลงทะเบียนภาพเป้าหมายไปยัง Atlas โดยใช้ affine ตามด้วย nonrigid B-spline
การลงทะเบียน จากนั้นฟอร์แมตป้ายชื่อ Atlas ใหม่เป็นรูปภาพเป้าหมาย
asegment_sri24
ลงทะเบียนภาพเป้าหมายไปยังช่องที่เลือกของแผนที่สมองมนุษย์ SRI24 จากนั้น
ฟอร์แมตป้ายชื่อ Atlas ใหม่กับรูปภาพเป้าหมาย หมายเหตุ: สมมติว่า
ภาพเป้าหมายเป็นลายกระโหลกศีรษะ กล่าวคือ มีเพียงสมองเท่านั้น
เฉลี่ย_affine
เครื่องมือนี้คำนวณค่าเฉลี่ยของลำดับของพิกัดความสอดคล้องที่ผู้ใช้ให้มา
การเปลี่ยนแปลง
เฉลี่ย_images
เครื่องมือนี้คำนวณค่าเฉลี่ย Pixelwiase ความแปรปรวน ส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐาน z-score หรือ
ภาพเอนโทรปีจากรายการภาพความเข้มที่ผู้ใช้ให้มา
เฉลี่ย_labels
รูปภาพฉลากที่ลงทะเบียนร่วมกันโดยเฉลี่ยโดยใช้ไดรฟ์ข้อมูลบางส่วน
เฉลี่ย_ผู้ดูแลระบบ
คำนวณภาพความเข้มเฉลี่ยของรูปร่างเฉลี่ยและแผนที่การเสียรูปโดยใช้แอกทีฟ
รูปแบบการเสียรูป
concat_affine
เครื่องมือนี้คำนวณการเชื่อมโยงที่ชัดเจนของหลาย affine ประสานงาน
การแปลงแต่ละแบบสามารถเลือกกลับด้านได้
แปลง_warp
เครื่องมือนี้แปลงพิกัดการเปลี่ยนรูปแบบอิสระ B-spline แบบไม่แข็ง
การเปลี่ยนแปลงระหว่างการแสดงที่แตกต่างกัน (เช่น สัมบูรณ์เทียบกับญาติ
เวกเตอร์) ยังสร้างการแปลงเศษส่วน
แปลง x
เครื่องมือนี้แปลงระหว่างรูปแบบไฟล์รูปภาพและประเภทข้อมูลพิกเซล สมัครได้ด้วยนะ
การดำเนินการกับรูปภาพที่ใช้งานง่ายทั่วไปในกระบวนการนี้ จำนวนโดยพลการของ
การดำเนินการสามารถระบุได้ในบรรทัดคำสั่ง ซึ่งจะนำไปใช้ใน
คำสั่งที่ได้รับ
ดีบีทูล
เครื่องมือนี้จะแก้ไขและสืบค้นฐานข้อมูลของรูปภาพและการแปลงระหว่าง
พวกเขา
ดีซีเอ็มทูอิมเมจ
รวมชุดของ DICOM สไลซ์เป็นสแต็กภาพ 3 มิติ
บรรยาย
เครื่องมือนี้พิมพ์คำอธิบายโดยละเอียดของไฟล์อินพุตเป็นรูปภาพหรือ
การเปลี่ยนแปลง
ทำลาย
โปรแกรมนี้แก้ไขลายทางในสแต็กรูปภาพที่ได้รับซึ่งอาจเป็นผลมาจาก
ความแตกต่างของสเกลความเข้มระหว่างสไลซ์
Detect_adni_phantom
เครื่องมือนี้ตรวจจับตำแหน่งของจุดสังเกตทรงกลมทั้งหมดในภาพ 3 มิติของ
Magphan EMR051 ภาพหลอนการสร้างภาพโครงสร้าง (aka ADNI Phantom)
Detect_spheres_matched_filter
เครื่องมือนี้ตรวจจับวัตถุทรงกลมในภาพสามมิติ
dof2mat
แปลงการแปลงความคล้ายคลึงจากการแทนค่าองศาอิสระเป็นรูปแบบเมทริกซ์
dwi_mask_bad_slices
เครื่องมือนี้จะอ่านชุดรูปภาพ MR ที่ถ่วงน้ำหนักแบบกระจาย 3 มิติ และค้นหาส่วนที่ไม่ถูกต้อง แย่
สไลซ์ในภาพที่แพร่จะถูกตรวจพบว่าเป็นภาพที่ความเข้มเฉลี่ยอยู่นอก a
ช่วงเวลาที่กำหนดรอบค่าเฉลี่ยของค่าเฉลี่ยของชิ้นส่วนที่เกี่ยวข้องทั้งหมดจาก
ภาพกระจายที่เหลือ
เอพิยูนวาร์ป
แก้ไขการบิดเบือนที่เกิดจากความไม่เท่าเทียมกันของฟิลด์ B0 ในภาพ Echo Planar (เช่น
ภาพที่ถ่วงน้ำหนักแบบกระจาย) โดยใช้สองภาพที่ได้รับด้วยการเข้ารหัสเฟสตรงข้าม
คำสั่ง
fib2image
ผลการติดตามไฟเบอร์จากเครื่องมือ UNC Fiber Tracking จะอ่านจากอินพุตมาตรฐาน
และจุดไฟเบอร์ทั้งหมดจะถูกวาดลงในภาพ 3 มิติ ผลลัพธ์ถูกเขียนในหนึ่งใน
รูปแบบไฟล์ภาพที่รองรับ
แก้ไขแบบฟอร์ม
ไฟล์ที่มีผลการติดตามไฟเบอร์จากเครื่องมือ UNC Fiber Tracking จะถูกอ่านจาก
อินพุตมาตรฐานและการแปลงพิกัดหนึ่งรายการขึ้นไป (ต่อกัน) ถูกนำไปใช้
ไปยังพิกัดจุดไฟเบอร์ทั้งหมด ผลลัพธ์ถูกเขียนไปยัง Standard Output อีกครั้งใน
รูปแบบไฟล์ไฟเบอร์ UNC
ฟิล์ม เครื่องมือนี้แบ่งอิมเมจอินพุตแบบแทรกสลับเป็นอิมเมจผ่าน ลงทะเบียนร่วมกัน
และสร้างภาพที่แก้ไขภาพเคลื่อนไหวขึ้นใหม่
กรอง
เครื่องมือนี้ใช้ตัวดำเนินการกรองเชิงพื้นที่ รวมทั้ง cnotent-sensitive
ตัวดำเนินการตามเมล็ดเกาส์เซียนที่คัดเลือก
fit_affine_dfield
ปรับการแปลงสัมพัทธ์เชิงเส้นให้เข้ากับการแปลงแบบไม่แข็ง อาจเป็น B-spline
การเปลี่ยนรูปอิสระหรือฟิลด์การเปลี่ยนรูปที่ไม่ใช่พารามิเตอร์
fit_affine_xform
ปรับการแปลงสัมพัทธ์เชิงเส้นเข้ากับรายการแบบต่อกัน, ทางเลือกกลับด้าน,
การเปลี่ยนแปลง
fit_affine_xform_จุดสังเกต
ปรับการแปลงความเกี่ยวข้องเชิงเส้นให้พอดีกับชุดของจุดสังเกตที่ตรงกัน
fit_spline_dfield
ปรับการแปลงแบบไม่ยึดตามพาราเมตริก (B-spline free-form deformation) เป็น a
สนามเปลี่ยนรูป
fit_spline_xform
ปรับการแปลงแบบไม่เคร่งครัดแบบพาราเมตริก (B-spline free-form deformation) ให้กับรายการ
ของการแปลงแบบเรียงต่อกัน สลับกันได้
มุมมอง
รูปทรงเรขาคณิต
เครื่องมือนี้จะอ่านรูปภาพตั้งแต่สองรูปขึ้นไปและทดสอบว่าขนาดกริดของรูปภาพนั้น pixel
ขนาดและการแปลงภาพเป็นช่องว่างตรงกัน หรือไม่ก็ได้ รูปภาพทั้งหมดคือ
ปรับแนวไปในทิศทางมาตรฐานก่อนทำการทดสอบ หากทุกภาพตรงกัน
เครื่องมือส่งคืนด้วยรหัสทางออก 0 มิฉะนั้นจะส่งคืนด้วยรหัสทางออก 2 ในกรณีของ
เกิดข้อผิดพลาด (เช่น ไม่สามารถอ่านภาพใดภาพหนึ่งได้) รหัสออกคือ 1
กล การสร้างแบบจำลองทางสถิติของความเข้มของพิกเซลในหลายภาพโดยใช้เส้นตรงทั่วไป
แบบ
อืม แบ่งภาพออกเป็นคลาส c โดยใช้อัลกอริธึม EM สำหรับส่วนผสมแบบเกาส์เซียนด้วย
นักบวชทางเลือก
เกรกซ์ฟอร์ม
เครื่องมือนี้เลิกใช้แล้ว โปรดใช้ streamxform แทน
groupwise_affine
เครื่องมือนี้ลงทะเบียนประชากรของรูปภาพอินพุตพร้อมกัน โดยไม่มีเทมเพลต
โดยใช้อัลกอริธึม 'congealing' หรือการวัดความคล้ายคลึงแบบกลุ่มตาม a
การประมาณข้อมูลร่วมกันอย่างต่อเนื่อง ('RMI')
groupwise_init
คำนวณการจัดตำแหน่ง Affine เริ่มต้นสำหรับกลุ่มของรูปภาพอินพุต ซึ่งสามารถใช้เป็น an
อินพุตสำหรับการลงทะเบียนแบบกลุ่ม
groupwise_warp
เครื่องมือนี้ลงทะเบียนประชากรของรูปภาพอินพุตพร้อมกันโดยไม่เข้มงวด โดยไม่มี a
เทมเพลต โดยใช้อัลกอริทึม 'การรวมตัวกัน' หรือการวัดความคล้ายคลึงแบบกลุ่ม
ขึ้นอยู่กับการประมาณอย่างต่อเนื่องของข้อมูลร่วมกัน ('RMI')
เฮาส์ดอร์ฟ
เครื่องมือนี้คำนวณระยะห่าง Hausdorff ระหว่างรูปภาพป้ายกำกับสองภาพ
histogram
สร้างฮิสโตแกรมของความเข้มของภาพและเขียนเป็นไฟล์ข้อความที่คั่นด้วยแท็บถึง
เอาต์พุตมาตรฐาน
จินตคณิต
ดำเนินการกับรูปภาพโดยใช้สัญกรณ์ postfix แบบสแต็ก
แทรกสลับ_bad_slices
เครื่องมือนี้จะอ่านอนุกรมเวลาของภาพ 3 มิติและตรวจจับค่าผิดปกติ
วนซ้ำ_รูปร่าง_ค่าเฉลี่ย
จิ๊บ เครื่องมือนี้แบ่งอิมเมจอินพุตแบบแทรกสลับเป็นอิมเมจผ่าน ลงทะเบียนร่วมกัน
และสร้างภาพที่แก้ไขภาพเคลื่อนไหวขึ้นใหม่
ชุดระดับ
การแบ่งส่วนประเภทชุดระดับของพื้นหน้า/พื้นหลังโดยใช้ความแปรปรวนระดับภูมิภาคขั้นต่ำ
พลังงาน
แอลเอ็มเอสบ้า
เครื่องมือนี้รวมการแบ่งเซ็กเมนต์หลายคลาสจากการลงทะเบียนร่วมและ
Atlases ที่จัดรูปแบบใหม่โดยใช้การเฉลี่ยตามรูปร่างที่ถ่วงน้ำหนักในเครื่อง
ลสบา เครื่องมือนี้รวมการแบ่งส่วนไบนารีหลายส่วนจากการลงทะเบียนร่วมและการจัดรูปแบบใหม่
Atlases โดยใช้การเฉลี่ยตามรูปร่างที่ถ่วงน้ำหนักในเครื่อง
โหวต
เครื่องมือนี้รวมการแบ่งส่วนหลายส่วนจาก atlases ที่ลงทะเบียนร่วมและจัดรูปแบบใหม่
โดยใช้การลงคะแนนแบบถ่วงน้ำหนักในพื้นที่
make_initial_affine
คำนวณการเปลี่ยนแปลงความชอบเริ่มต้นโดยการจัดตำแหน่งศูนย์กลางของมวลหรือแกนหลัก
mat2dof
แปลงเมทริกซ์การแปลงเป็นองศาอิสระ
แมคคาฟิน
การลงทะเบียนภาพที่สัมพันธ์กันแบบหลายช่องสัญญาณโดยใช้ฮิสโตแกรมหรือความแปรปรวนร่วม
มาตรการเอนโทรปีร่วม
แมควาร์ป
การลงทะเบียนรูปภาพ B-spline nonrigid หลายช่องสัญญาณโดยใช้ฮิสโตแกรมหรือ
มาตรการเอนโทรปีร่วมตามความแปรปรวนร่วม
mk_adni_phantom
สร้างภาพของภาพจำลองการปรับเทียบภาพโครงสร้าง ADNI (aka Magphan
EMR051).
mk_analyze_hdr
สร้างไฟล์ส่วนหัวตามรูปแบบ Analzye 7.5 ตามพารามิเตอร์ที่ผู้ใช้จัดหาให้
เรขาคณิต ชนิดข้อมูล การวางแนว ฯลฯ
mk_nifti_hdr
สร้างไฟล์ส่วนหัวตามรูปแบบไฟล์ NIFTI ตามพารามิเตอร์ที่ผู้ใช้ระบุสำหรับ
เรขาคณิต ชนิดข้อมูล การวางแนว ฯลฯ
mk_phantom_3d
สร้างภาพหลอนดิจิทัล 3 มิติโดยใช้คำสั่งการวาดที่เลือก
คุณนาย
โปรแกรมนี้แก้ไขสิ่งแปลกปลอมที่ไม่เท่ากันในรูปภาพ MR โดยใช้อคติ
ฟิลด์ที่ประมาณโดยการลดค่าเอนโทรปี
คาบเกี่ยวกัน
คำนวณการวัดทับซ้อนระหว่างสองภาพขึ้นไป
การสอบสวน
เครื่องมือนี้พิมพ์ค่าพิกเซลหรือป้ายสัญลักษณ์ที่รายการภาพที่ผู้ใช้ให้มา
พิกัด.
ค้นหา px
เครื่องมือนี้อ่านไฟล์รูปภาพ รวมถึงรายการพิกัดพิกเซลจากมาตรฐาน
ป้อนข้อมูล. สำหรับแต่ละพิกเซล พื้นที่ใกล้เคียงในรูปภาพจะถูกค้นหาด้วย
มูลค่าสูงสุด ตำแหน่งของค่าสูงสุดจะถูกเขียนไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
ฟอร์แมต x
เครื่องมือฟอร์แมตไดรฟ์ข้อมูลแบบขยายเพื่อคำนวณภาพที่จัดรูปแบบใหม่และแผนที่จาโคเบียนจาก
ลำดับโดยพลการของการแปลงที่ต่อกัน
การลงทะเบียน
โปรแกรมนี้ดำเนินการลงทะเบียนรูปภาพที่เข้มงวดและเชื่อมโยงโดยใช้หลายความละเอียด
การปรับให้เหมาะสมของการวัดความคล้ายคลึงกันของรูปภาพที่ใช้ voxel
การลงทะเบียนx
โปรแกรมนี้ดำเนินการลงทะเบียนรูปภาพที่เข้มงวดและเชื่อมโยงโดยใช้หลายความละเอียด
การปรับให้เหมาะสมของการวัดความคล้ายคลึงกันของรูปภาพที่ใช้ voxel
ถอยหลัง
การถดถอยเชิงเส้น (และพหุนามลำดับที่สูงกว่า) ของฟิลด์และรูปภาพที่เปลี่ยนรูป
ปรับทิศทางใหม่
แปลงระหว่างการวางแนวของภาพ กล่าวคือ จัดเรียงพิกเซลอาร์เรย์ใหม่ตามจริงแล้วปรับตัว
เก็บข้อมูลการวางแนวกายวิภาค
SBA การแบ่งกลุ่มเฉลี่ย (ช่องป้ายกำกับ) โดยใช้การแปลงระยะทางแบบยุคลิด ทั้งหมด
ภาพที่ป้อนจะต้องอยู่ในพื้นที่เดียวกัน EDT ถูกคำนวณในพื้นที่นี้ด้วย ดู
http://dx.doi.org/10.1109/TIP.2006.884936 สำหรับรายละเอียดของอัลกอริธึมพื้นฐาน
สบาย การแบ่งกลุ่มเฉลี่ย (ช่องป้ายกำกับ) โดยใช้การแปลงระยะทางแบบยุคลิด นี้
เครื่องมือทำการประมาณค่าร่วมและหาค่าเฉลี่ยโดยการประมาณค่าจาก EDT นี้
กำหนดให้อินพุตเป็นการแปลงจากแบบคงที่เป็น (ไม่จำเป็น)
ภาพเคลื่อนไหวที่แตกต่างกัน การคำนวณ EDT ทำได้ในพื้นที่ของภาพเคลื่อนไหวแต่ละภาพ
ดู http://dx.doi.org/10.1109/TIP.2006.884936 เพื่อดูรายละเอียดพื้นฐาน
ขั้นตอนวิธี
ลำดับ
วิเคราะห์ลำดับของค่าตัวเลข ซึ่งอ่านจากอินพุตมาตรฐาน
ความคล้ายคลึงกัน
คำนวณการวัดความคล้ายคลึงกัน เช่น ความแตกต่างของความเข้มหรือฉลากคาบเกี่ยวกันระหว่าง
สองภาพ
แยก
แยกภาพปริมาณออกเป็นภาพย่อย กล่าวคือ เพื่อแยกภาพที่แทรกระหว่างเส้นผ่าน
สถิติ
การคำนวณทางสถิติเกี่ยวกับความเข้มของพิกเซลของภาพ เช่น ค่าเฉลี่ยและมาตรฐาน
เบี่ยงเบน
สตรีม_พิกเซล
เครื่องมือนี้อ่านหนึ่งภาพขึ้นไปและเขียนพิกเซลทั้งหมดไปยังเอาต์พุตมาตรฐานใน
แบบฟอร์มไบนารี อีกทางหนึ่ง ภาพแต่ละภาพสามารถปรับเปลี่ยนตามลักษณะทางกายวิภาคที่ระบุได้
การวางแนวและ/หรือแปลงเป็นข้อมูลประเภทอื่น สิ่งนี้มีประโยชน์สำหรับการวางท่อ
ข้อมูลภาพผ่านไปป์ไลน์ เช่น ชุดเครื่องมือ Camino DTI
สตรีมxform
รายการพิกัดจุดในรูปแบบ ASCII จะถูกอ่านจากอินพุตมาตรฐานและผู้ใช้-
ลำดับของการแปลงพิกัดที่ให้ไว้ (แต่ละตัวเลือกกลับด้าน) จะถูกนำไปใช้
ถึงพวกเขา. จากนั้นจุดเปลี่ยนจะถูกเขียนไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
อาการ
คำนวณระนาบสมมาตรโดยประมาณของรูปภาพเพื่อกำหนด เช่น
ระนาบกลางทัลในภาพสมองของมนุษย์ รองรับรูปแบบต่างๆ ของการส่งออก
เช่น การเขียนภาพที่ป้อนโดยวาดระนาบสมมาตรลงไป หรืออินพุต
ภาพที่จัดแนวใหม่ตามแนวระนาบสมมาตร
Symplx
คำนวณระนาบสมมาตรโดยประมาณของรูปภาพเพื่อกำหนด เช่น
ระนาบกลางทัลในภาพสมองของมนุษย์ รองรับรูปแบบต่างๆ ของการส่งออก
เช่น การเขียนภาพที่ป้อนโดยวาดระนาบสมมาตรลงไป หรืออินพุต
ภาพที่จัดแนวใหม่ตามแนวระนาบสมมาตร
ทดสอบ
การทดสอบตามพิกเซลที่มีนัยสำคัญทางสถิติ ยังคำนวณสหสัมพันธ์และ z-scores
แยกไม่ออก
รวมกองรูปภาพที่แยกจากกันเป็นโวลุ่มรูปภาพเดี่ยว
unwarp_image_phantom
เครื่องมือนี้คำนวณการแปลงพหุนามหรือรูปแบบอิสระ B-spline
การเปลี่ยนรูปเพื่อคลายภาพ การเปลี่ยนแปลงเป็นไปตามที่คาดไว้และตรวจพบ
สถานที่สำคัญในภาพหลอนเชิงโครงสร้างที่ได้รับจากเครื่องสแกนเดียวกัน ใช้
เครื่องมือ 'detect_adni_phantom' เพื่อตรวจจับจุดสังเกตของ ADNI Phantom ในภาพและ
สร้างไฟล์คำอธิบายแฝงที่เหมาะสมสำหรับใช้กับเครื่องมือนี้
vol2csv
เครื่องมือนี้คำนวณปริมาณของภูมิภาคในภาพฉลาก มันเป็นทางเลือกยอมรับ
แผนที่ความหนาแน่น (เช่น สำหรับเนื้อเยื่อต่างๆ) และคำนวณและพิมพ์ตามภูมิภาค
เนื้อหาสำหรับแต่ละ นอกจากนี้ เครื่องมือยังสามารถยอมรับการแมป 'ปริมาณพิกเซล' ที่เป็นตัวเลือกไปยังบัญชี
สำหรับการเปลี่ยนแปลงปริมาณพิกเซลในพื้นที่ เช่น เนื่องจากการบิดเบือนเชิงพื้นที่
ปริมาณ_injection
สร้างโวลุ่มความละเอียดสูงขึ้นใหม่จากการลงทะเบียนร่วมหลายรายการ (ความละเอียดต่ำ)
ภาพโดยใช้การฉีดปริมาณไปข้างหน้า
ปริมาณ_การสร้างใหม่
การสร้างโวลุ่มแบบวนซ้ำจากภาพที่ลงทะเบียนร่วมกันโดยใช้การแก้ไขแบบผกผัน
หรือการเบลอร่วมกัน
vtkxform.php?
ไฟล์ VTK รูปแบบ ASCII ถูกอ่านจากอินพุตมาตรฐานและพิกัดที่ผู้ใช้ระบุ
การแปลง (เป็นทางเลือก) ใช้กับพิกัดจุดยอด A VTK
ไฟล์ที่มีจุดแปลงจะถูกเขียนไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
วิปริต โปรแกรมนี้ดำเนินการลงทะเบียนรูปภาพแบบไม่เข้มงวดโดยใช้การปรับให้เหมาะสมหลายความละเอียด
ของการวัดความคล้ายคลึงกันของภาพที่ใช้ voxel และ B-spline . แบบหลายความละเอียด
แบบจำลองการเปลี่ยนแปลง
วาร์ป2ps
เขียนฟิลด์การเปลี่ยนรูปเป็นตารางผิดรูปในรูปแบบ PostScript สำหรับการแสดงภาพและ
ภาพประกอบ
วาร์ป
โปรแกรมนี้ดำเนินการลงทะเบียนรูปภาพแบบไม่เข้มงวดโดยใช้การปรับให้เหมาะสมหลายความละเอียด
ของการวัดความคล้ายคลึงกันของภาพที่ใช้ voxel และ B-spline . แบบหลายความละเอียด
แบบจำลองการเปลี่ยนแปลง
xform2dfield
แปลงการแปลงพาราเมตริกแบบแข็งหรือแบบไม่แข็งเป็นฟิลด์การเสียรูป สุ่มตัวอย่างที่
ตำแหน่งพิกเซลของภาพอ้างอิงที่กำหนด
xform2itk
เครื่องมือนี้แปลงการแปลงพิกัดจากรูปแบบ CMTK เป็นรูปแบบ ITK และใน
กระบวนการยังแก้ไขความแตกต่างในข้อตกลงพิกัดภาพ
xform2สเกลาร์
เครื่องมือนี้แยกการวัดสเกลาร์จากการแปลงและฟิลด์การเปลี่ยนรูป
สุ่มตัวอย่างที่ตำแหน่งกริด และเขียนผลลัพธ์ลงในรูปภาพ ตัวอย่างที่รองรับ
การวัดสเกลาร์คือ: x,y,z องค์ประกอบของการแปลง, ขนาดของ
การเปลี่ยนแปลงและดีเทอร์มิแนนต์จาโคเบียน
ผู้เขียน
Torsten Rohlfing โดยได้รับการสนับสนุนจาก Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff และ Yaroslav Halchenko
ใช้ cmtk ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net