นี่คือคำสั่ง cmtk-reformatx ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
ฟอร์แมตx - ฟอร์แมตโวลุ่มที่ฟอร์แมตใหม่
เรื่องย่อ
ฟอร์แมต x [ตัวเลือก] --floating floatImg เป้าหมาย x0 [x1 ...]
หรือฟอร์แมตใหม่ [ตัวเลือก] เป้าหมาย [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
หรือที่ไหน x0 ... xN และ xx0 ... xxN คือ [{-i,--inverse}] การแปลง## (ถ้าเป็นคนแรก
การแปลงในลำดับจะกลับด้าน ดังนั้น '--ผกผัน' จะต้องนำหน้าด้วย '--'
เช่น ใช้ '-- --inverse xform.path')
DESCRIPTION
เครื่องมือฟอร์แมตไดรฟ์ข้อมูลแบบขยายเพื่อคำนวณภาพที่จัดรูปแบบใหม่และแผนที่จาโคเบียนจาก
ลำดับโดยพลการของการแปลงที่ต่อกัน
OPTIONS
เหตุการณ์ที่ Toolkit Options (เหล่านี้ เป็น ที่ใช้ร่วมกัน by ทั้งหมด ซี.เอ็ม.ที.เค เครื่องมือ)
--ช่วยด้วย
เขียนรายการตัวเลือกบรรทัดคำสั่งพื้นฐานไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
-- ช่วยทั้งหมด
เขียนรายการตัวเลือกบรรทัดคำสั่งพื้นฐานและขั้นสูงทั้งหมดลงในเอาต์พุตมาตรฐาน
--วิกิ
เขียนรายการตัวเลือกบรรทัดคำสั่งไปยังเอาต์พุตมาตรฐานในมาร์กอัปมีเดียวิกิ
--ชาย
เขียนแหล่งที่มาของหน้าคนในมาร์กอัป 'nroff' ไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
--รุ่น
เขียนเวอร์ชันชุดเครื่องมือไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
--เสียงสะท้อน
เขียนบรรทัดคำสั่งปัจจุบันไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
--verbose-ระดับ
กำหนดระดับการใช้คำฟุ่มเฟือย
--รายละเอียด, -v
เพิ่มระดับการใช้คำฟุ่มเฟือยขึ้น 1 (เลิกใช้แล้ว รองรับความเข้ากันได้แบบย้อนหลัง)
--กระทู้
ตั้งค่าจำนวนเธรดแบบขนานสูงสุด (สำหรับเธรด POSIX และ OpenMP)
- ประเภทเอาต์พุต
ชนิดข้อมูลสเกลาร์สำหรับภาพที่ส่งออก ค่าที่รองรับ: "ถ่าน", "ไบต์", "สั้น",
"ushort", "int", "uint", "float", "double" หรือใช้สิ่งใดสิ่งหนึ่งต่อไปนี้:
--ถ่าน
8 บิต, ลงนาม
--ไบต์
8 บิต, ไม่ได้ลงนาม
--สั้น
16 บิต, ลงนาม
--ushort
16 บิต, ไม่ได้ลงนาม
--int
ลงนาม 32 บิต
--uint
ไม่ได้ลงนาม 32 บิต
--ลอย
จุดลอยตัว 32 บิต
--สองเท่า
จุดลอยตัว 64 บิต
--pad-ออก , -P
ค่าการเติมสำหรับภาพที่ส่งออก [ค่าเริ่มต้น: 0]
Options for ที่ราบ การจัดรูปแบบใหม่
--การแก้ไข
วิธีการแก้ไขภาพ ค่าที่รองรับ: "linear", "nn", "cubic", "pv", "sinc-
cosine", "sinc-hamming" โดยค่าเริ่มต้นคือ "linear" หรือใช้สิ่งใดสิ่งหนึ่งต่อไปนี้:
--เชิงเส้น
การแก้ไขแบบไตรลิเนียร์ [นี้ is ค่าเริ่มต้น]
--nn การแก้ไขเพื่อนบ้านที่ใกล้ที่สุด
--ลูกบาศก์
การแก้ไขแบบไตรคิวบิก
--พีวี การแก้ไขปริมาตรบางส่วน
--sinc-โคไซน์
การประมาณค่าแบบซิงโครนัสกับหน้าต่างโคไซน์
--sinc-ตอก
การแก้ไข Sinc กับหน้าต่าง Hamming
--sinc-window-รัศมี
รัศมีหน้าต่างสำหรับการแก้ไข Sinc [ค่าเริ่มต้น: 3]
--รักษามวล
การจัดรูปแบบใหม่เพื่อรักษามวล: คูณทุกค่าที่จัดรูปแบบใหม่ด้วย Jacobian
ดีเทอร์มิแนนต์ของการแปลงแบบประยุกต์
Options for จาโคเบียน แผนที่ การจัดรูปแบบใหม่
--jacobian-ถูกต้องทั่วโลก
แก้ไขแผนที่จาโคเบียนสำหรับระดับโลก
--no-jacobian-ถูกต้องทั่วโลก
อย่าแก้ไขแผนที่จาโคเบียนสำหรับระดับโลก [นี้ is ค่าเริ่มต้น]
อินพุต Options
--target-กริด
กำหนดตารางเป้าหมายสำหรับการจัดรูปแบบใหม่เป็น Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]
(หรี่แสง:พิกเซล:ออฟเซ็ต)
--หน้ากาก, -m
ใช้ข้อมูลพิกเซลเป้าหมายเป็นมาสก์ไบนารี
--พืช
ครอบตัดรูปภาพเป้าหมาย: x0,y0,z0,x1,y1,z2
--เป้าหมายชดเชย , -O
แทนที่ออฟเซ็ตรูปภาพเป้าหมายและตั้งค่าเป็น x,y,z mm
--เป้าหมาย-ออฟเซ็ต-พิกเซล
แทนที่ภาพเป้าหมายออฟเซ็ตและตั้งค่าเป็น dx,dy,dz pixels
--ลอยน้ำ , -F
รูปแบบและเส้นทางของภาพลอยตัว [ค่าเริ่มต้น: ไม่มี]
--แผ่นลอย
ค่าแพดดิ้งสำหรับรูปภาพลอยตัว [ค่าเริ่มต้น: พิการ]
เอาท์พุต Options
--outfile , -o
รูปแบบและเส้นทางของภาพที่ส่งออก [ค่าเริ่มต้น: ฟอร์แมต.nii ]
รูปภาพ/การแปลงร่าง ฐานข้อมูล
--ฐานข้อมูล
เส้นทางไปยังฐานข้อมูลภาพ/การแปลงที่ควรปรับปรุงด้วยการสร้างใหม่
ภาพ. [ค่าเริ่มต้น: ไม่มี]
ผู้เขียน
Torsten Rohlfing โดยได้รับการสนับสนุนจาก Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff และ Yaroslav Halchenko
ใช้ cmtk-reformatx ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
