นี่คือคำสั่ง cmtk-unwarp_image_phantom ที่สามารถทำงานในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
unwarp_image_phantom - สร้างการแปลงเพื่อ unwarp รูปภาพตาม phantom
ลักษณะ
เรื่องย่อ
unwarp_image_phantom อินพุต Phantom InputImage OutputXform
DESCRIPTION
เครื่องมือนี้คำนวณการแปลงพหุนามหรือการเปลี่ยนรูปแบบอิสระ B-spline เป็น
แกะรูปภาพ การเปลี่ยนแปลงเป็นไปตามที่คาดไว้และจุดสังเกตที่ตรวจพบใน an
ภาพหลอนโครงสร้างที่ได้รับจากเครื่องสแกนเดียวกัน ใช้ 'detect_adni_phantom'
เครื่องมือตรวจจับจุดสังเกตของ ADNI Phantom ในภาพและสร้าง phantom
ไฟล์คำอธิบายที่เหมาะสำหรับใช้กับเครื่องมือนี้
OPTIONS
เหตุการณ์ที่ Toolkit Options (เหล่านี้ เป็น ที่ใช้ร่วมกัน by ทั้งหมด ซี.เอ็ม.ที.เค เครื่องมือ)
--ช่วยด้วย
เขียนรายการตัวเลือกบรรทัดคำสั่งพื้นฐานไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
-- ช่วยทั้งหมด
เขียนรายการตัวเลือกบรรทัดคำสั่งพื้นฐานและขั้นสูงทั้งหมดลงในเอาต์พุตมาตรฐาน
--วิกิ
เขียนรายการตัวเลือกบรรทัดคำสั่งไปยังเอาต์พุตมาตรฐานในมาร์กอัปมีเดียวิกิ
--ชาย
เขียนแหล่งที่มาของหน้าคนในมาร์กอัป 'nroff' ไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
--รุ่น
เขียนเวอร์ชันชุดเครื่องมือไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
--เสียงสะท้อน
เขียนบรรทัดคำสั่งปัจจุบันไปยังเอาต์พุตมาตรฐาน
--verbose-ระดับ
กำหนดระดับการใช้คำฟุ่มเฟือย
--รายละเอียด, -v
เพิ่มระดับการใช้คำฟุ่มเฟือยขึ้น 1 (เลิกใช้แล้ว รองรับความเข้ากันได้แบบย้อนหลัง)
--กระทู้
ตั้งค่าจำนวนเธรดแบบขนานสูงสุด (สำหรับเธรด POSIX และ OpenMP)
ฟิตติ้ง Options
--พอดีผกผัน
พอดีกับการแปลงผกผัน (การทำแผนที่จริงกับตำแหน่งจุดสังเกตที่คาดหวัง) นี่คือ
มีประโยชน์สำหรับการคำนวณแผนที่การแก้ไขระดับเสียงจาโคเบียน (โดยใช้ 'reformatx') โดยไม่ต้องใช้
ต้องสลับการแปลงที่ไม่บิดเบี้ยวที่พอดีด้วยตัวเลข
--พอดีไปข้างหน้า
พอดีกับการเปลี่ยนแปลงไปข้างหน้า (การทำแผนที่ที่คาดว่าจะเป็นสถานที่สำคัญจริง) นี่คือ
มีประโยชน์สำหรับการแก้ไขภาพผ่านการ reslicing (โดยใช้ 'reformatx') [นี้ is
ค่าเริ่มต้น]
การแปลง Models
--เส้นโค้ง
พอดีกับการเสียรูปฟรีฟอร์ม B-spline
--โพลี
พอดีกับการแปลงพหุนาม [นี้ is ค่าเริ่มต้น]
พหุนาม ฟิตติ้ง Options (กับ --โพลี)
--ระดับ
ระดับของการแปลงพหุนามที่พอดี [ค่าเริ่มต้น: 4]
บี-สไปลน์ ฟิตติ้ง Options (กับ --เส้นโค้ง)
--final-cp-ระยะห่าง
ระยะห่างกริดจุดควบคุมสุดท้ายของการแปลง B-spline เอาต์พุต [ค่าเริ่มต้น: 0]
--final-cp-สลัว
มิติตารางจุดควบคุมสุดท้าย (เช่น จำนวนจุดควบคุม) ของเอาต์พุต B-
การแปลงเส้นโค้ง กำหนดให้เป็น 'dimX,dimY,dimZ' [ค่าเริ่มต้น: ไม่มี]
--ระดับ
จำนวนระดับในขั้นตอนการประมาณค่า B-spline หลายระดับ [ค่าเริ่มต้น: 1]
--iterations-per-ระดับ
จำนวนสูงสุดของการวนซ้ำค่าสัมประสิทธิ์ spline ต่อระดับในหลายระดับ
ขั้นตอนการประมาณ B-spline [ค่าเริ่มต้น: 100]
--rms-เกณฑ์
เกณฑ์สำหรับการปรับปรุงสัมพัทธ์ของสารตกค้างที่เหมาะสม RMS การวนซ้ำที่เหมาะสม
ยุติถ้า (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate)/rmsBeforeUpdate < threshold
[ค่าเริ่มต้น: 0]
--ไม่มีความพอดี
ปิดใช้งานการปรับความพอดีของการแปลงความคล้ายคลึงเพื่อเริ่มต้น spline ให้พอดี spline
โดยตรง. ซึ่งมักจะให้ผลลัพธ์ที่แย่ลงและท้อแท้
ผู้เขียน
Torsten Rohlfing โดยได้รับการสนับสนุนจาก Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff และ Yaroslav Halchenko
ใช้ cmtk-unwarp_image_phantom ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
