นี่คือคำสั่ง edialigne ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
edialign - การจัดตำแหน่งหลายลำดับในเครื่อง
เรื่องย่อ
เรียบเรียง -ลำดับ การตั้งค่า -นูคโหมด รายการ -revcomp บูล [-ทับซ้อนกัน การเลือก]
[-เชื่อมโยง รายการ] [-maxfragl จำนวนเต็ม] -แฟรกแมท บูล -แฟรกซิม จำนวนเต็ม
[-itcore บูล] [-เกณฑ์ ลอย] - หน้ากาก บูล -dostars บูล
-สตาร์นัม จำนวนเต็ม -outfile ออกจากไฟล์ -outseq ผลสืบเนื่อง
เรียบเรียง -ช่วยด้วย
DESCRIPTION
เรียบเรียง เป็นโปรแกรมบรรทัดคำสั่งจาก EMBOSS (“ the European Molecular Biology Open
ชุดซอฟต์แวร์”) เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มคำสั่ง "Alignment:Multiple"
OPTIONS
อินพุต ส่วน
-ลำดับ การตั้งค่า
เพิ่มเติม ส่วน
-นูคโหมด รายการ
โหมดการจัดลำดับกรดนิวคลีอิก (แบบง่าย แปลหรือผสม) ค่าเริ่มต้น: n
-revcomp บูล
ค่าเริ่มต้น: N
-ทับซ้อนกัน การเลือก
ตามค่าเริ่มต้น น้ำหนักทับซ้อนจะใช้เมื่อ Nseq =<35 แต่คุณสามารถตั้งค่านี้เป็น 'ใช่' หรือ
'ไม่' ค่าเริ่มต้น: ค่าเริ่มต้น (เมื่อ Nseq =< 35)
-เชื่อมโยง รายการ
วิธีการจัดกลุ่มเพื่อสร้างแผนผังลำดับ (UPGMA การเชื่อมโยงขั้นต่ำหรือสูงสุด
การเชื่อมโยง) ค่าเริ่มต้น: UPGMA
-maxfragl จำนวนเต็ม
ค่าเริ่มต้น: 40
-แฟรกแมท บูล
ค่าเริ่มต้น: N
-แฟรกซิม จำนวนเต็ม
ค่าเริ่มต้น: 4
-itcore บูล
ค่าเริ่มต้น: N
-เกณฑ์ ลอย
ค่าเริ่มต้น: 0.0
เอาท์พุต ส่วน
- หน้ากาก บูล
ค่าเริ่มต้น: N
-dostars บูล
ค่าเริ่มต้น: N
-สตาร์นัม จำนวนเต็ม
ค่าเริ่มต้น: 4
-outfile ออกจากไฟล์
-outseq ผลสืบเนื่อง
ใช้ edialigne ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
