นี่คือคำสั่ง EDTSurf ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
EDTSurf - การสร้างพื้นผิวโมเลกุลขนาดใหญ่ที่รวดเร็วและแม่นยำ
เรื่องย่อ
อีดีเซิร์ฟ -i pdbname ...
DESCRIPTION
EDTSurf เป็นโปรแกรมโอเพ่นซอร์สเพื่อสร้างพื้นผิวสามเหลี่ยมสำหรับโมเลกุลขนาดใหญ่ มัน
สร้างพื้นผิวโมเลกุลขนาดใหญ่สามพื้นผิว: พื้นผิว van der Waals ตัวทำละลายเข้าถึงได้
พื้นผิวและพื้นผิวโมเลกุล (พื้นผิวที่ไม่รวมตัวทำละลาย) EDTsurf ยังระบุฟันผุ
ซึ่งอยู่ภายในโมเลกุลขนาดใหญ่
OPTIONS
-o นามสกุล
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-บริสุทธิ์ 2-อะตอม 3-chain
-p รัศมีโพรบ [0,2.0]
-f ตัวคูณมาตราส่วน (0,20.0]
-h 1เข้าและออก2ออก3in
เอาต์พุต 1: outname.ply
เอาต์พุต 2: outname.asa
เอาต์พุต 3: outname-cav.pdb
ใช้ EDTSurf ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net