นี่คือคำสั่ง fastaq-trim_contigs ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
fastaq_trim_contigs - ตัดจำนวนฐานที่ตั้งไว้ในตอนท้ายของทุก contig
DESCRIPTION
การใช้งาน: fastaq_trim_contigs [ตัวเลือก]
ตัดฐานจำนวนที่กำหนดไว้ในตอนท้ายของทุก contig เพื่อให้ช่องว่างใหญ่ขึ้นและต่อเนื่อง
ปลายจะถูกลบออก ฐานถูกแทนที่ด้วย Ns ลำดับใด ๆ ที่จบลงด้วย Ns ทั้งหมดหายไป
ตำแหน่ง ข้อโต้แย้ง:
infile ชื่อไฟล์อินพุต
ออกจากไฟล์
ชื่อของไฟล์เอาต์พุต
ไม่จำเป็น ข้อโต้แย้ง:
-h, --ช่วยด้วย
แสดงข้อความช่วยเหลือนี้และออก
--trim_number TRIM_NUMBER
จำนวนฐานที่จะตัดรอบแต่ละช่องว่าง และปิดปลายของแต่ละลำดับ [100]
ใช้ fastaq-trim_contigs ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
