fpromlke - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

fpromlk - สายวิวัฒนาการของโปรตีนตามโอกาสสูงสุด

เรื่องย่อ

fpromlk -ลำดับ ซีกเซ็ตทั้งหมด -อินทรีไฟล์ ต้นไม้ [-หมวดหมู่ จำนวนเต็ม] -ประเมินค่า แถว
- หมวดหมู่ คุณสมบัติ [- น้ำหนัก คุณสมบัติ] -ความยาว บูล [-แบบอย่าง รายการ]
[-แกมมา รายการ] -ค่าสัมประสิทธิ์แกมมา ลอย -งามแมว จำนวนเต็ม - ค่าสัมประสิทธิ์คงที่ ลอย
-นินวาร์กัต จำนวนเต็ม -อินวาร์ฟรัค ลอย -nhmmหมวดหมู่ จำนวนเต็ม -อืม แถว
-hmmprobability แถว -adjsite บูล -แลมบ์ดา ลอย -สับสน จำนวนเต็ม
- เมล็ด จำนวนเต็ม -ทั่วโลก บูล [-outgrno จำนวนเต็ม] -outfile ออกจากไฟล์ [-ปลาเทราท์ ข้อศอก]
-outtreefile ออกจากไฟล์ [-ข้อมูลการพิมพ์ บูล] [-ความคืบหน้า บูล] [-พิมพ์ต้นไม้ บูล]
[-hypstate บูล]

fpromlk -ช่วยด้วย

DESCRIPTION

fpromlk เป็นโปรแกรมบรรทัดคำสั่งจาก EMBOSS (“ the European Molecular Biology Open
ชุดซอฟต์แวร์”) เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มคำสั่ง "Phylogeny:Molecular sequence"

OPTIONS

อินพุต ส่วน
-ลำดับ ซีกเซ็ตทั้งหมด
ไฟล์ที่มีการจัดตำแหน่งลำดับอย่างน้อยหนึ่งรายการ

-อินทรีไฟล์ ต้นไม้

-หมวดหมู่ จำนวนเต็ม
ค่าเริ่มต้น: 1

-ประเมินค่า แถว

- หมวดหมู่ คุณสมบัติ

- น้ำหนัก คุณสมบัติ

เพิ่มเติม ส่วน
-ความยาว บูล
ค่าเริ่มต้น: N

-แบบอย่าง รายการ
ค่าเริ่มต้น: Jones-Taylor-Thornton

-แกมมา รายการ
ค่าเริ่มต้น: n

-ค่าสัมประสิทธิ์แกมมา ลอย
ค่าเริ่มต้น: 1

-งามแมว จำนวนเต็ม
ค่าเริ่มต้น: 1

- ค่าสัมประสิทธิ์คงที่ ลอย
ค่าเริ่มต้น: 1

-นินวาร์กัต จำนวนเต็ม
ค่าเริ่มต้น: 1

-อินวาร์ฟรัค ลอย
ค่าเริ่มต้น: 0.0

-nhmmหมวดหมู่ จำนวนเต็ม
ค่าเริ่มต้น: 1

-อืม แถว
ค่าเริ่มต้น: 1.0

-hmmprobability แถว
ค่าเริ่มต้น: 1.0

-adjsite บูล
ค่าเริ่มต้น: N

-แลมบ์ดา ลอย
ค่าเริ่มต้น: 1.0

-สับสน จำนวนเต็ม

- เมล็ด จำนวนเต็ม
ค่าเริ่มต้น: 1

-ทั่วโลก บูล
ค่าเริ่มต้น: N

-outgrno จำนวนเต็ม

เอาท์พุต ส่วน
-outfile ออกจากไฟล์

-ปลาเทราท์ ข้อศอก
ค่าเริ่มต้น: Y

-outtreefile ออกจากไฟล์

-ข้อมูลการพิมพ์ บูล
ค่าเริ่มต้น: N

-ความคืบหน้า บูล
ค่าเริ่มต้น: Y

-พิมพ์ต้นไม้ บูล
ค่าเริ่มต้น: Y

-hypstate บูล
ค่าเริ่มต้น: N

ใช้ fpromlke ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net