นี่คือคำสั่ง fsl-5.0-core ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
fsl - เครื่องมือวิเคราะห์สำหรับการถ่ายภาพสมอง FMRI, MRI และ DTI
DESCRIPTION
FSL เป็นชุดเครื่องมือที่ครอบคลุมสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลการถ่ายภาพสมองทางการแพทย์ มัน
จัดเตรียมเครื่องมือสำหรับการประมวลผลข้อมูลล่วงหน้า การแยกสมอง การลงทะเบียนภาพ ตลอดจน a
สเปกตรัมกว้างของการวิเคราะห์ทางสถิติ FSL ให้ GUI ที่ใช้งานง่าย
FSL ต้องตั้งค่าตัวแปรสภาพแวดล้อมจำนวนหนึ่งอย่างเหมาะสม เพื่อให้บรรลุสิ่งนี้
โปรดจัดหาสคริปต์การกำหนดค่าจาก /etc/fsl/5.0/fsl.sh วิธีหนึ่งในการทำสิ่งนี้
โดยอัตโนมัติคือการเพิ่มบรรทัดที่มี
- /etc/fsl/5.0/fsl.sh
ไปยังไฟล์ .bashrc ในโฮมไดเร็กทอรีของผู้ใช้ (หรือไฟล์ที่เกี่ยวข้องสำหรับเชลล์อื่นๆ
กว่าทุบตี) คุณอาจต้องสร้างไฟล์ดังกล่าวก่อน
อีกทางหนึ่ง แพ็คเกจ Debian จะติดตั้ง symlink สำหรับเครื่องมือ FSL ทั้งหมดใน / usr / bin ที่
ดูแลการโหลดการกำหนดค่าที่เหมาะสมโดยอัตโนมัติ ชื่อลิงก์สัญลักษณ์คือ
นำหน้าด้วย FSL เวอร์ชันเพื่อป้องกันความขัดแย้งของชื่อไฟล์และอนุญาต
หลายเวอร์ชันเพื่ออยู่ร่วมกันในระบบเดียวกัน ตัวอย่างเช่น เครื่องตัด คำสั่งคือ
ใช้ได้เป็น fsl5.0-ตัวแบ่งส่วนข้อมูล. โปรดทราบว่าสำหรับการใช้ FSL เครื่องมือผ่าน symlink เหล่านี้คือ
ไม่ จำเป็นเพื่อดำเนินการตามขั้นตอนการตั้งค่าที่อธิบายไว้ข้างต้น อย่างไรก็ตาม ความสะดวกนี้
คุณลักษณะเป็นแบบเฉพาะเดเบียน สคริปต์ที่ใช้คำสั่ง FSL และมีวัตถุประสงค์เพื่อใช้ร่วมกัน
กับผู้อื่นควรอาศัยชื่อคำสั่งที่ไม่มีคำนำหน้าและตัวแปรสภาพแวดล้อม FSL
ติดตั้ง.
พื้นที่ FSL อินเทอร์เฟซผู้ใช้บางครั้งหมายถึง an FSLDIR. บนระบบ Debian นี่คือ
/usr/share/fsl/5.0 สำหรับ FSL เวอร์ชัน 5.0
FSL เอกสารและความช่วยเหลือออนไลน์จัดทำโดย fsl-5.0-doc บรรจุภัณฑ์
คำถามเกี่ยวกับการใช้ FSL หรือทฤษฎีที่เกี่ยวข้องสามารถโพสต์บน FSL ทางไปรษณีย์
รายการ (ดู http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).
ขนานกัน
FSL สามารถกำหนดค่าให้ส่งงานไปยัง Sun Gridengine (SGE) ที่ทำงานอยู่ได้ ทั้งที่ยังไม่หมด
ฟังก์ชันที่ใช้งานใน FSL รองรับการขนานประเภทนี้ ซึ่งเป็นความต้องการสูงสุด
เครื่องมือประมวลผล (เช่น POSSUM และ FDT) ทำ
FSL ควรจะใช้ SGE ได้แม้ว่าจะไม่ได้ตั้งค่าตัวแปรสภาพแวดล้อม SGE_ROOT เช่นเดียวกับใน
กรณีของแพ็คเกจ Debian ของ SGE หากต้องการเปิดใช้งานการประมวลผลแบบกลุ่ม ให้ตั้งค่า
FSLPพาราเรล=1
ในเชลล์ที่ FSL ทำงานอยู่ สามารถเปิดใช้งานได้อย่างถาวรใน
/etc/fsl/5.0/fsl.sh
หรือแล้วแต่กรณี
ใช้ fsl-5.0-core ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
