นี่คือคำสั่ง gmod_sort_gff3.plp ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
gmod_sort_gff3.pl - จัดเรียงไฟล์ GFF3 เพื่อวางบรรทัดด้วยแท็กหลักหลังพาเรนต์
เรื่องย่อ
% gmod_sort_gff3.pl --infile
บรรทัดคำสั่ง OPTIONS
--infile ชื่อของไฟล์อินพุต gff3 (จำเป็น)
--outfile ชื่อของเอาต์พุต gff3 file
(ค่าเริ่มต้น: sorted.gff)
DESCRIPTION
นี่เป็นสคริปต์ที่ง่ายมาก (และทดสอบเพียงเล็กน้อย) สำหรับการเรียงลำดับไฟล์ gff3 เพื่อให้ทั้งหมด
บรรทัดที่มีแท็กหลักจะอยู่หลังบรรทัดที่มีแท็ก ID หลัก ไฟล์
ดังนั้นการเรียงลำดับจึงจำเป็นสำหรับ GMOD chado bulk loader, gmod_bulk_load_gff3.pl
ผู้เขียน
สก็อตต์ เคน[ป้องกันอีเมล]>
ลิขสิทธิ์ (c) 2006
ห้องสมุดนี้เป็นซอฟต์แวร์ฟรี คุณสามารถแจกจ่ายซ้ำและ/หรือแก้ไขภายใต้รายการเดียวกันได้
เงื่อนไขเป็น Perl เอง
ใช้ gmod_sort_gff3.plp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
