นี่คือคำสั่ง gt-eval ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
gt-eval - เปรียบเทียบไฟล์คำอธิบายประกอบและแสดงการวัดความแม่นยำ (การทำนายเทียบกับข้อมูลอ้างอิง)
เรื่องย่อ
gt ประเมิน ข้อมูลอ้างอิง_ไฟล์การทำนาย_ไฟล์
DESCRIPTION
-nuc [ใช่|ไม่]
ประเมินระดับนิวคลีโอไทด์ (การใช้หน่วยความจำเป็นสัดส่วนกับขนาดไฟล์อินพุต)
(ค่าเริ่มต้น: ใช่)
-ลิตร [ใช่|ไม่]
ประเมินการทำนาย LTR retrotransposon แทนการทำนายยีน (ทั้งหมด
อิลิเมนต์ LTR_retrotransposon ถูกพิจารณาว่ามีเกลียวที่ไม่ได้กำหนดไว้) (ค่าเริ่มต้น:
ไม่)
-ltrdelta [ความคุ้มค่า]
ตั้งค่าเดลต้าที่อนุญาตสำหรับเส้นขอบ LTR ให้ถือว่าเท่ากัน (ค่าเริ่มต้น: 20)
-v [ใช่|ไม่]
ละเอียด (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-o [ชื่อไฟล์]
เปลี่ยนเส้นทางเอาต์พุตไปยังไฟล์ที่ระบุ (ค่าเริ่มต้น: ไม่ได้กำหนด)
-gzip [ใช่|ไม่]
เขียนไฟล์เอาต์พุตที่บีบอัด gzip (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-bzip2 [ใช่|ไม่]
เขียนไฟล์เอาต์พุตบีบอัด bzip2 (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-บังคับ [ใช่|ไม่]
บังคับให้เขียนไปยังไฟล์เอาต์พุต (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-ช่วยด้วย
แสดงความช่วยเหลือและออก
-version
แสดงข้อมูลเวอร์ชันและออก
โปรแกรมแสดงค่าความไวและความจำเพาะสำหรับคุณลักษณะบางประเภท (เช่น
ยีน mRNA และ exon) สำหรับคุณสมบัติบางประเภทจำนวนคุณสมบัติที่ขาดหายไปและไม่ถูกต้องของ
ประเภทนั้นจะแสดงด้วย ดังนั้น “ขาด” หมายถึงจำนวนคุณสมบัติของประเภทนั้นจาก
“การอ้างอิง” โดยไม่ทับซ้อนกับคุณสมบัติของประเภทนั้นจาก “การทำนาย” รอง
ในทางกลับกัน “ผิด” หมายถึงจำนวนของคุณสมบัติของประเภทนั้นจาก “การทำนาย” โดยไม่ต้อง
ทับซ้อนกับคุณสมบัติของประเภทนั้นจาก “การอ้างอิง”
รายงาน ข้อบกพร่อง
รายงานจุดบกพร่องไปที่[ป้องกันอีเมล]>.
ใช้ gt-eval ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
