mia-2dmyoica-full - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

mia-2dmyoica-full - ดำเนินการลงทะเบียนชุดภาพ 2D

เรื่องย่อ

mia-2dmyoica-เต็ม -i -o [ตัวเลือก]

DESCRIPTION

mia-2dmyoica-เต็ม โปรแกรมนี้ใช้เวอร์ชัน 2D ของการชดเชยการเคลื่อนไหว
อัลกอริทึมที่อธิบายไว้ใน Wollny G, Kellman P, Santos A, Ledesma-Carbayo MJ, "อัตโนมัติ
การชดเชยการเคลื่อนไหวของการหายใจอิสระที่ได้รับข้อมูลของกล้ามเนื้อหัวใจตายโดยใช้
การวิเคราะห์ส่วนประกอบอิสระ", Medical Image Analysis, 2012,
ดอย:10.1016/j.media.2012.02.004. ซอฟต์แวร์อาจเรียกใช้การลงทะเบียนเชิงเส้นก่อนแล้วจึง
การลงทะเบียนแบบไม่เชิงเส้นหรือเพียงอย่างใดอย่างหนึ่งเท่านั้น โปรแกรมเวอร์ชันนี้อาจทำงานทั้งหมด
การลงทะเบียนควบคู่กันไป

OPTIONS

ไฟล์-IO
-i --in-file=(อินพุต, จำเป็น); สตริง
ป้อนข้อมูลชุดข้อมูลการกระจาย

-o --out-file=(เอาต์พุต, จำเป็น); สตริง
ชุดข้อมูลการกระจายเอาต์พุต

-r --ลงทะเบียน=
ฐานชื่อไฟล์สำหรับภาพที่ลงทะเบียน ประเภทรูปภาพและรูปแบบการนับ
ถูกนำมาจากภาพที่ป้อนเข้าตามที่กำหนดในชุดข้อมูลที่ป้อนเข้า

--save-cropped=(เอาต์พุต); สตริง
บันทึกชุดที่ครอบตัดลงในไฟล์นี้ ไฟล์ภาพจะใช้ต้นกำเนิดของชื่อ
เป็นฐานชื่อไฟล์

--save-feature=(เอาต์พุต); สตริง
บันทึกภาพคุณสมบัติการแบ่งส่วนและเมทริกซ์การผสม ICA เริ่มต้น

--save-refs=(เอาต์พุต); สตริง
สำหรับการลงทะเบียนแต่ละครั้งผ่านบันทึกภาพอ้างอิงไปยังไฟล์ที่มีให้
ฐานชื่อ

--save-regs=(เอาต์พุต); สตริง
สำหรับการลงทะเบียนแต่ละครั้งให้บันทึกภาพที่ลงทะเบียนระดับกลาง

การช่วยเหลือ & ข้อมูล
-V --verbose=คำเตือน
ความละเอียดของผลลัพธ์ พิมพ์ข้อความในระดับที่กำหนดและลำดับความสำคัญที่สูงกว่า
ลำดับความสำคัญที่รองรับเริ่มต้นที่ระดับต่ำสุดคือ:
ข้อมูล - ข้อความระดับต่ำ
ติดตาม - การติดตามการเรียกใช้ฟังก์ชัน
ล้มเหลว - รายงานความล้มเหลวในการทดสอบ
คำเตือน - คำเตือน
ความผิดพลาด - รายงานข้อผิดพลาด
การแก้ปัญหา - ดีบักเอาท์พุต
ข่าวสาร - ข้อความปกติ
ร้ายแรง - รายงานเฉพาะข้อผิดพลาดร้ายแรง

--ลิขสิทธิ์
พิมพ์ข้อมูลลิขสิทธิ์

-h -- ช่วยด้วย
พิมพ์ความช่วยเหลือนี้

-? --การใช้งาน
พิมพ์ความช่วยเหลือสั้น ๆ

--รุ่น
พิมพ์หมายเลขรุ่นและออก

ICA
-C --ส่วนประกอบ=0
ส่วนประกอบ ICA 0 = การประมาณค่าอัตโนมัติส่วนประกอบ ICA 0 = อัตโนมัติ
การประเมิน

--ทำให้เป็นปกติ
ไอซีปกติ

--no-meantrip
อย่าดึงค่าเฉลี่ยออกจากเส้นโค้งผสม

-s --segscale=0
ส่วนและปรับขนาดกล่องครอบตัดรอบส่วน LV (0=ไม่มีการแบ่งส่วน) และ
ปรับขนาดกล่องครอบตัดรอบ LV (0=ไม่มีการแบ่งส่วน)

-k --ข้าม=0
ข้ามภาพที่ตอนต้นของซีรีส์ เช่น เพราะมันเป็นของคนอื่น
modalitiesข้ามภาพที่ตอนต้นของซีรีส์เช่นเพราะตามที่พวกเขา
เป็นแบบอย่างอื่นๆ

-m --max-ica-iter=400
จำนวนการวนซ้ำสูงสุดใน ICA จำนวนการวนซ้ำสูงสุดใน ICA

-E --segmethod=คุณสมบัติ
วิธีการแบ่งกลุ่ม
เดลต้า-พีค - ความแตกต่างของภาพเพิ่มประสิทธิภาพสูงสุด
คุณสมบัติ - คุณสมบัติรูปภาพ
คุณลักษณะเดลต้า - ความแตกต่างของภาพคุณสมบัติ

-b --นาทีหายใจ-ความถี่=-1
ความถี่เฉลี่ยขั้นต่ำที่กราฟผสมสามารถพิจารณาได้ว่ามาจาก
การหายใจ อัตราการหายใจขณะพักผ่อนที่ดีต่อสุขภาพคือ 12 ต่อนาที ค่าลบ
ปิดใช้งานการทดสอบ ค่า 0.0 บังคับให้ชุดข้อมูลระบุเป็น
ได้มาจากการกลั้นหายใจครั้งแรก ความถี่เฉลี่ยต่ำสุดที่เส้นโค้งผสมสามารถ
ต้องพิจารณาว่าเกิดจากความบริบูรณ์ อัตราการหายใจขณะพักผ่อนที่ดีต่อสุขภาพคือ
12 ต่อนาที ค่าลบจะปิดการทดสอบ ค่า 0.0 บังคับให้
ชุดที่จะระบุว่าได้มาด้วยการกลั้นหายใจครั้งแรก

การประมวลผล
--กระทู้=-1
จำนวนเธรดสูงสุดที่จะใช้สำหรับการประมวลผล จำนวนนี้ควรต่ำกว่า
หรือเท่ากับจำนวนคอร์ตัวประมวลผลเชิงตรรกะในเครื่อง (-1:
การประมาณค่าอัตโนมัติ) จำนวนเธรดสูงสุดที่จะใช้สำหรับการประมวลผลนี้
จำนวนควรต่ำกว่าหรือเท่ากับจำนวนคอร์ตัวประมวลผลเชิงตรรกะใน
เครื่องจักร. (-1: การประมาณค่าอัตโนมัติ)

ลงทะเบียน
-L --linear-optimizer=gsl:opt=simplex,ขั้นตอน=1.0
ตัวเพิ่มประสิทธิภาพที่ใช้สำหรับการย่อเล็กสุดของการลงทะเบียนเชิงเส้น ค่าสตริง
จะใช้ในการสร้างปลั๊กอิน สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
PLUGINS:ตัวย่อ/ราคาเดียว

--linear-transform=affine
การแปลงเชิงเส้นที่จะใช้ ค่าสตริงจะถูกใช้ในการสร้าง a
เสียบเข้าไป. สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดู PLUGINS:2dimage/transform

-O --ตัวเพิ่มประสิทธิภาพที่ไม่ใช่เชิงเส้น=gsl:opt=gd,step=0.1
Optimizer ใช้สำหรับย่อเล็กสุดในการลงทะเบียนแบบไม่เชิงเส้น สตริง
ค่าจะถูกใช้เพื่อสร้างปลั๊กอิน สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
PLUGINS:ตัวย่อ/ราคาเดียว

-a --start-c-rate=16
เริ่มอัตรา coefficinet ในเงี่ยง หารด้วย --c-rate-divider with
ทุก pass.start อัตรา coefficinet ในหนาม จะถูกหารด้วย
--c-rate-divider ทุกครั้งที่ผ่าน

--c-อัตรา-ตัวแบ่ง=2
ตัวแบ่งอัตรา coficient สำหรับแต่ละรอบ ตัวแบ่งอัตรา coficient สำหรับแต่ละรอบ

-d --start-divcurl=10000
เริ่ม divcurl น้ำหนัก ถูกหารด้วย --divcurl-divider ด้วย every
pass.Start divcurl weight ถูกหารด้วย --divcurl-divider ด้วย every
ผ่านไป

--divcurl-ตัวแบ่ง=2
การสเกลน้ำหนัก Divcurl กับแต่ละรอบใหม่ การสเกลน้ำหนัก Divcurl แต่ละรายการ
ผ่านใหม่

-R --อ้างอิง=-1
การอ้างอิงทั่วโลก รูปภาพทั้งหมดควรอยู่ในแนวเดียวกัน หากกำหนดเป็นค่าที่ไม่เป็นลบ
ค่ารูปภาพจะถูกจัดชิดกับการอ้างอิงนี้และผลลัพธ์ที่ครอบตัด
วันที่ของภาพจะถูกฉีดเข้าไปในภาพต้นฉบับ ออกที่ -1 ถ้าคุณ
ไม่สนใจ ในกรณีนี้ ภาพทั้งหมดที่มีการลงทะเบียนไปยังตำแหน่งเฉลี่ยของ
การเคลื่อนไหวGlobalอ้างอิงรูปภาพทั้งหมดควรอยู่ในแนวเดียวกัน หากตั้งค่าเป็น
ค่าที่ไม่เป็นลบ รูปภาพจะสอดคล้องกับการอ้างอิงนี้และ
วันที่ของภาพที่ส่งออกที่ถูกครอบตัดจะถูกแทรกเข้าไปในภาพต้นฉบับ ทิ้ง
ที่ -1 ถ้าคุณไม่สนใจ ในกรณีนี้ รูปภาพทั้งหมดจะต้องลงทะเบียนกับ a
ตำแหน่งเฉลี่ยของการเคลื่อนไหว

-w --imagecost=image:weight=1,cost=ssd
ค่ารูปภาพ ไม่ต้องระบุพารามิเตอร์ src และ ref ค่าเหล่านี้จะถูกตั้งค่าโดย
โปรแกรม. ค่าสตริงจะถูกใช้เพื่อสร้างปลั๊กอิน สำหรับ
ปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดู PLUGINS:2dimage/fullcost

-l --mg-ระดับ = 3
ระดับความละเอียดหลายระดับหลายระดับความละเอียด

-p --linear-pass=3
การลงทะเบียนเชิงเส้นผ่าน (0 เพื่อปิดใช้งาน) การลงทะเบียนเชิงเส้นผ่าน (0 ถึง
ปิดการใช้งาน)

-P --nlinear-passes=3
การลงทะเบียนแบบไม่เชิงเส้นผ่าน (0 เพื่อปิดใช้งาน) การลงทะเบียนแบบไม่เชิงเส้นผ่าน
(0 เพื่อปิดการใช้งาน)

ปลั๊กอิน: 1d/slinebc

กระจก เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไข Spline ที่สะท้อนบนขอบเขต

(ไม่มีพารามิเตอร์)

ทำซ้ำ เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไข Spline ที่ซ้ำค่าที่ขอบเขต

(ไม่มีพารามิเตอร์)

เป็นศูนย์ เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไข Spline ที่ถือว่าศูนย์สำหรับค่าภายนอก

(ไม่มีพารามิเตอร์)

ปลั๊กอิน: 1d/เคอร์เนลเส้นโค้ง

บีสไปลน์ การสร้างเคอร์เนล B-spline พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

d = 3; int ใน [0, 5]
องศาของเส้นโค้ง

ออมม่า การสร้างเคอร์เนล OMoms-spline พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

d = 3; int ใน [3, 3]
องศาของเส้นโค้ง

ปลั๊กอิน: 2dimage/ราคา

lncc สหสัมพันธ์ข้ามทำให้เป็นมาตรฐานในเครื่องพร้อมรองรับการกำบัง, พารามิเตอร์ที่รองรับ
คือ:

w = 5; ใน [1, 256]
ครึ่งความกว้างของหน้าต่างที่ใช้สำหรับประเมินกากบาทที่แปลแล้ว
ความสัมพันธ์

LSD วัดระยะทางที่น้อยที่สุด

(ไม่มีพารามิเตอร์)

mi ข้อมูลร่วมกันตาม Spline parzen พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ตัด = 0; ลอยอยู่ใน [0, 40]
เปอร์เซ็นต์ของพิกเซลที่จะตัดที่ความเข้มสูงและต่ำที่จะลบออก
ค่าผิดปกติ

ถังขยะ = 64; ใน [1, 256]
จำนวนช่องฮิสโตแกรมที่ใช้สำหรับภาพเคลื่อนไหว

เคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนล Spline สำหรับภาพเคลื่อนไหว parzen hinstogram สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ
ดู PLUGINS:1d/splinekernel

rbin = 64; ใน [1, 256]
จำนวนช่องฮิสโตแกรมที่ใช้สำหรับรูปภาพอ้างอิง

เคอร์เนล = [bspline:d=0]; โรงงาน
เคอร์เนล Spline สำหรับภาพอ้างอิง parzen hinstogram สำหรับปลั๊กที่รองรับ-
ดู PLUGINS:1d/splinekernel

NCC ความสัมพันธ์ข้ามมาตรฐาน

(ไม่มีพารามิเตอร์)

อึ้ง ฟังก์ชันนี้จะประเมินความคล้ายคลึงของภาพตามการไล่ระดับสีปกติ
ฟิลด์ มีเมล็ดการประเมินต่างๆ ให้เลือก พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ประเมิน = ดีเอส; dict
ประเภทย่อยของปลั๊กอิน ค่าที่รองรับคือ:
sq - สแควร์ของความแตกต่าง
ds - กำลังสองของผลต่างมาตราส่วน
จุด - เคอร์เนลผลิตภัณฑ์สเกลาร์
ข้าม - เคอร์เนลข้ามผลิตภัณฑ์

SSD ต้นทุนภาพ 2 มิติ: ผลรวมของผลต่างกำลังสอง พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

อัตโนมัติ = 0; ลอยอยู่ใน [0, 1000]
ใช้การปิดบังภาพเคลื่อนไหวโดยอัตโนมัติโดยใช้ค่าความเข้มเท่านั้น
ให้มีขนาดใหญ่กว่าเกณฑ์ที่กำหนด

บรรทัดฐาน = 0; บูล
กำหนดว่าควรปรับเมตริกให้เป็นมาตรฐานด้วยจำนวนพิกเซลของรูปภาพหรือไม่

ssd-ออโต้มาสก์
ต้นทุนภาพ 2 มิติ: ผลรวมของส่วนต่างกำลังสอง พร้อมการมาร์กอัตโนมัติตามที่กำหนด
เกณฑ์ พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

rthresh = 0; สองเท่า
ค่าความเข้มของเกณฑ์สำหรับรูปภาพอ้างอิง

นวด = 0; สองเท่า
ค่าความเข้มของเกณฑ์สำหรับรูปภาพต้นฉบับ

ปลั๊กอิน: 2dimage/เต็มราคา

ภาพ ฟังก์ชันต้นทุนความคล้ายคลึงกันของภาพทั่วไปที่รองรับความละเอียดหลายภาพ
กำลังประมวลผล. การวัดความคล้ายคลึงที่แท้จริงจะได้รับเป็นพารามิเตอร์พิเศษ
พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ราคา = เอสเอสดี; โรงงาน
เคอร์เนลฟังก์ชันต้นทุน สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่ PLUGINS:2dimage/cost

การแก้ปัญหา = 0; บูล
บันทึก resuts ระดับกลางสำหรับการดีบัก

อ้าง =(อินพุต, สตริง)
ภาพอ้างอิง

สิ่งอำนวยความสะดวก =(อินพุต, สตริง)
ภาพการศึกษา

น้ำหนัก = 1; ลอย
น้ำหนักของฟังก์ชันต้นทุน

ภาพฉลาก
ฟังก์ชันต้นทุนที่คล้ายคลึงกันซึ่งจับคู่ป้ายกำกับของรูปภาพสองภาพและจัดการป้ายกำกับ-
รักษาการประมวลผลหลายความละเอียด พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

การแก้ปัญหา = 0; int ใน [0, 1]
เขียนระยะทางแปลงเป็นภาพ 3 มิติ

ฉลากสูงสุด = 256; int ใน [2, 32000]
จำนวนฉลากสูงสุดที่ต้องพิจารณา

อ้าง =(อินพุต, สตริง)
ภาพอ้างอิง

สิ่งอำนวยความสะดวก =(อินพุต, สตริง)
ภาพการศึกษา

น้ำหนัก = 1; ลอย
น้ำหนักของฟังก์ชันต้นทุน

ภาพสวมหน้ากาก
ฟังก์ชันต้นทุนความคล้ายคลึงกันของภาพที่ปิดบังโดยทั่วไปที่ยังจัดการหลาย-
การประมวลผลความละเอียด มาสก์ที่ให้มาควรเป็นบริเวณที่เติมอย่างแน่นหนาใน
การประมวลผลแบบหลายความละเอียดเพราะไม่เช่นนั้นข้อมูลมาสก์อาจสูญหาย
เมื่อลดขนาดภาพ มาสก์อ้างอิงและมาสก์ที่แปลงร่างของ
ภาพการศึกษาถูกรวมเข้าด้วยกันโดยไบนารีและ การวัดความคล้ายคลึงที่แท้จริงจะได้รับ
es พารามิเตอร์พิเศษ พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ราคา = เอสเอสดี; โรงงาน
เคอร์เนลฟังก์ชันต้นทุน สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:2dimage/maskedcost

อ้าง =(อินพุต, สตริง)
ภาพอ้างอิง

หน้ากากอ้างอิง =(อินพุต, สตริง)
มาสก์รูปภาพอ้างอิง (ไบนารี)

สิ่งอำนวยความสะดวก =(อินพุต, สตริง)
ภาพการศึกษา

Src-mask =(อินพุต, สตริง)
ศึกษาภาพมาสก์ (ไบนารี)

น้ำหนัก = 1; ลอย
น้ำหนักของฟังก์ชันต้นทุน

ปลั๊กอิน: ภาพ 2 มิติ/io

BMP รองรับอินพุต/เอาต์พุตภาพ BMP 2D

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .BMP, .bmp

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, 16 บิตที่ไม่ได้ลงนาม

ฐานข้อมูล Virtual IO เข้าและออกจากพูลข้อมูลภายใน

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .@

ไดคอม ภาพ 2 มิติ io สำหรับ DICOM

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .DCM, .dcm

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
เซ็นชื่อ 16 บิต ไม่ได้ลงนาม 16 บิต

EXR ปลั๊กอิน 2dimage io สำหรับอิมเมจ OpenEXR

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .EXR, .exr

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ไม่ได้ลงนาม 32 บิต, จุดลอยตัว 32 บิต

jpg ปลั๊กอิน 2dimage io สำหรับ jpeg ภาพระดับสีเทา

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ไม่ได้ลงนาม 8 บิต

PNG ปลั๊กอิน 2dimage io สำหรับรูปภาพ png

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .PNG, .png

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, 16 บิตที่ไม่ได้ลงนาม

ดิบ รองรับเอาต์พุตภาพ RAW 2D

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .RAW, .raw

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต,
เซ็นชื่อ 32 บิต, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, ทศนิยม 32 บิต, ทศนิยม 64
บิต

TIF รองรับอินพุต/เอาต์พุตภาพ TIFF 2D

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, 16 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม

ทิวทัศน์ ปลั๊กอิน 2dimage io สำหรับรูปภาพ vista

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .V, .VISTA, .v, .vista

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต,
เซ็นชื่อ 32 บิต, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, ทศนิยม 32 บิต, ทศนิยม 64
บิต

ปลั๊กอิน: 2dimage/หน้ากากราคา

lncc สหสัมพันธ์ข้ามทำให้เป็นมาตรฐานในเครื่องพร้อมรองรับการกำบัง, พารามิเตอร์ที่รองรับ
คือ:

w = 5; ใน [1, 256]
ครึ่งความกว้างของหน้าต่างที่ใช้สำหรับประเมินกากบาทที่แปลแล้ว
ความสัมพันธ์

mi ข้อมูลร่วมกันตาม Spline parzen พร้อมการปิดบัง พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ตัด = 0; ลอยอยู่ใน [0, 40]
เปอร์เซ็นต์ของพิกเซลที่จะตัดที่ความเข้มสูงและต่ำที่จะลบออก
ค่าผิดปกติ

ถังขยะ = 64; ใน [1, 256]
จำนวนช่องฮิสโตแกรมที่ใช้สำหรับภาพเคลื่อนไหว

เคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนล Spline สำหรับภาพเคลื่อนไหว parzen hinstogram สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ
ดู PLUGINS:1d/splinekernel

rbin = 64; ใน [1, 256]
จำนวนช่องฮิสโตแกรมที่ใช้สำหรับรูปภาพอ้างอิง

เคอร์เนล = [bspline:d=0]; โรงงาน
เคอร์เนล Spline สำหรับภาพอ้างอิง parzen hinstogram สำหรับปลั๊กที่รองรับ-
ดู PLUGINS:1d/splinekernel

NCC ความสัมพันธ์ข้ามมาตรฐานกับการสนับสนุนการกำบัง

(ไม่มีพารามิเตอร์)

SSD ผลรวมของผลต่างกำลังสองกับการมาส์ก

(ไม่มีพารามิเตอร์)

ปลั๊กอิน: 2dimage/แปลงร่าง

Affine การแปลงแบบ Affine (อิสระหกองศา) พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

เข้มงวด การแปลงแบบแข็ง (เช่น การหมุนและการแปล สามองศาของ
เสรีภาพ) พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

ศูนย์เน่า = [[0,0]]; 2dfเวกเตอร์
จุดศูนย์กลางการหมุนสัมพัทธ์ คือ <0.5,0.5> ตรงกับจุดศูนย์กลางของ
รองรับสี่เหลี่ยมผืนผ้า

การหมุน การแปลงการหมุน (เช่น การหมุนรอบจุดศูนย์กลางที่กำหนด หนึ่งองศาของ
เสรีภาพ) พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

ศูนย์เน่า = [[0,0]]; 2dfเวกเตอร์
จุดศูนย์กลางการหมุนสัมพัทธ์ คือ <0.5,0.5> ตรงกับจุดศูนย์กลางของ
รองรับสี่เหลี่ยมผืนผ้า

เส้นโค้ง การแปลงรูปแบบอิสระที่สามารถอธิบายได้ด้วยชุดสัมประสิทธิ์ B-spline
และเคอร์เนล B-spline พื้นฐาน พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

แอนิโซเรท = [[0,0]]; 2dfเวกเตอร์
อัตราสัมประสิทธิ์แอนไอโซทรอปิกเป็นพิกเซล ค่าที่ไม่เป็นบวกจะเป็น
เขียนทับโดยค่า 'อัตรา'..

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

เมล็ด = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลการแปลง spline.. สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

การลงโทษ = ; โรงงาน
ระยะโทษของการเปลี่ยนแปลง สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:2dtransform/splinepenalty

อัตรา = 10; ลอยใน [1, inf)
อัตราสัมประสิทธิ์ไอโซโทรปิก หน่วยเป็นพิกเซล

แปลความ การแปลเท่านั้น (อิสระสององศา) พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

vf ปลั๊กอินนี้ใช้การแปลงที่กำหนดการแปลสำหรับแต่ละ
จุดกริดที่กำหนดโดเมนของการเปลี่ยนแปลง, รองรับ
พารามิเตอร์คือ:

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

ปลั๊กอิน: 2dtransform/slinepenalty

ดิวิเคิร์ล บทลงโทษ divcurl ในการแปลง พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

โค้ง = 1; ลอยใน [0, inf)
น้ำหนักโทษเมื่อขด

div = 1; ลอยใน [0, inf)
น้ำหนักโทษบนไดเวอร์เจนซ์

บรรทัดฐาน = 0; บูล
ตั้งค่าเป็น 1 หากการปรับโทษควรจะเป็นมาตรฐานที่เกี่ยวกับภาพ
ขนาด.

น้ำหนัก = 1; ลอยเข้ามา (0, inf)
น้ำหนักของพลังงานโทษ

ปลั๊กอิน: ตัวย่อ/ราคาเดียว

กดา การไล่ระดับสีแบบไล่ระดับพร้อมการแก้ไขขนาดขั้นตอนอัตโนมัติ พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ฟุตอลร์ = 0; สองเท่าใน [0, inf)
หยุดถ้าการเปลี่ยนแปลงสัมพัทธ์ของเกณฑ์อยู่ด้านล่าง..

ขั้นตอนสูงสุด = 2; สองเท่าใน (0, inf)
ขนาดขั้นสัมบูรณ์สูงสุด

แม็กซิเตอร์ = 200; uint ใน [1, inf)
เกณฑ์การหยุด: จำนวนการวนซ้ำสูงสุด

นาทีขั้นตอน = 0.1; สองเท่าใน (0, inf)
ขนาดขั้นตอนที่แน่นอนน้อยที่สุด

เอ็กซ์โตลา = 0.01; สองเท่าใน [0, inf)
หยุดถ้า inf-norm ของการเปลี่ยนแปลงที่ใช้กับ x ต่ำกว่าค่านี้..

ตร.ม โคตรไล่ระดับด้วยการประมาณขั้นกำลังสอง พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ฟุตอลร์ = 0; สองเท่าใน [0, inf)
หยุดถ้าการเปลี่ยนแปลงสัมพัทธ์ของเกณฑ์อยู่ด้านล่าง..

กโตล่า = 0; สองเท่าใน [0, inf)
หยุดถ้า inf-norm ของการไล่ระดับสีต่ำกว่าค่านี้..

แม็กซิเตอร์ = 100; uint ใน [1, inf)
เกณฑ์การหยุด: จำนวนการวนซ้ำสูงสุด

ขนาด = 2; สองเท่าใน (1, inf)
การปรับขนาดขั้นตอนทางเลือกสำรอง

ขั้นตอน = 0.1; สองเท่าใน (0, inf)
ขนาดขั้นเริ่มต้น

เอ็กซ์โตลา = 0; สองเท่าใน [0, inf)
หยุดถ้า inf-norm ของ x-update ต่ำกว่าค่านี้..

GSL ปลั๊กอินเพิ่มประสิทธิภาพตามตัวเพิ่มประสิทธิภาพมัลติมินของ GNU Scientific Library
(GSL) https://www.gnu.org/software/gsl/ พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

กำไรต่อหุ้น = 0.01; สองเท่าใน (0, inf)
เครื่องมือเพิ่มประสิทธิภาพตามการไล่ระดับสี: หยุดเมื่อ |grad| < eps, simplex: หยุดเมื่อ
ขนาดซิมเพล็กซ์ < eps..

เราเตอร์ = 100; uint ใน [1, inf)
จำนวนการทำซ้ำสูงสุด

เลือก = gd; คำสั่ง
เครื่องมือเพิ่มประสิทธิภาพเฉพาะที่จะใช้.. ค่าที่รองรับคือ:
bfg - บรอยเดน-เฟลตเชอร์-โกลด์ฟาร์บ-แชนน์
bfgs2 ‐ Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shann (รุ่นที่มีประสิทธิภาพสูงสุด)
cg-fr Flecher-Reeves คอนจูเกตอัลกอริธึมการไล่ระดับสี
gd - การไล่ระดับสี
เริม - อัลกอริธึม Simplex ของ Nelder และ Mead
cg-pr - Polak-Ribiere คอนจูเกตอัลกอริทึมการไล่ระดับสี

ขั้นตอน = 0.001; สองเท่าใน (0, inf)
ขนาดขั้นตอนเริ่มต้น

ดัน = 0.1; สองเท่าใน (0, inf)
พารามิเตอร์ความอดทนบางอย่าง

ไม่มี อัลกอริทึม Minimizer โดยใช้ไลบรารี NLOPT สำหรับคำอธิบายของ
เครื่องมือเพิ่มประสิทธิภาพ โปรดดู 'http://ab-
initio.mit.edu/wiki/index.php/NOpt_Algorithms' พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ฟุตลา = 0; สองเท่าใน [0, inf)
เกณฑ์การหยุด: การเปลี่ยนแปลงที่แน่นอนของมูลค่าวัตถุประสงค์อยู่ด้านล่าง
ค่านี้

ฟุตอลร์ = 0; สองเท่าใน [0, inf)
เกณฑ์การหยุด: การเปลี่ยนแปลงสัมพัทธ์ของมูลค่าวัตถุประสงค์อยู่ด้านล่าง
ค่านี้

สูงกว่า = อินฟ; สองเท่า
ขอบเขตที่สูงขึ้น (เท่ากับพารามิเตอร์ทั้งหมด)

เลือกท้องถิ่น = ไม่มี; dict
อัลกอริธึมการลดขนาดท้องถิ่นที่อาจจำเป็นสำหรับ main
อัลกอริทึมการย่อขนาด.. ค่าที่รองรับคือ:
gn-orig-โดยตรง-l ‐ การแบ่งสี่เหลี่ยม (การใช้งานดั้งเดิม,
ลำเอียงในท้องถิ่น)
gn-ตรง-l-noscal ‐ สี่เหลี่ยมผืนผ้าหาร
gn-isres - ปรับปรุงกลยุทธ์การวิวัฒนาการอันดับแบบสุ่ม
ld-tnewton - นิวตันที่ถูกตัดทอน
gn-ตรง-l-rand ‐ การแบ่งสี่เหลี่ยม (ลำเอียงเฉพาะที่ สุ่ม)
ln-newuoa ‐ อนุพันธ์ฟรีไม่มีข้อจำกัดการเพิ่มประสิทธิภาพโดย Iteratively
สร้างการประมาณกำลังสอง
gn-ตรง-l-แรนด์-noscale ‐ แบ่งสี่เหลี่ยม (ไม่มีมาตราส่วน เฉพาะที่
ลำเอียงสุ่ม)
gn-ต้นกำเนิดโดยตรง ‐ การแบ่งสี่เหลี่ยม (การใช้งานดั้งเดิม)
ld-tnewton-precond - นิวตันตัดปลายที่ปรับสภาพแล้ว
ld-tnewton-รีสตาร์ท ‐ ตัดทอนนิวตันด้วยการรีสตาร์ทที่ชันที่สุด
gn-ตรง - การแบ่งสี่เหลี่ยม
ln-neldermead - อัลกอริธึม Nelder-Mead simplex
ln-โคบีล่า ‐ การเพิ่มประสิทธิภาพที่มีข้อจำกัด โดยการประมาณเชิงเส้น
gn-crs2-lm - ควบคุมการค้นหาแบบสุ่มด้วยการกลายพันธุ์ในพื้นที่
ld-var2 ‐ Shifted Limited-Memory Variable-Metric อันดับ 2
ld-var1 ‐ Shifted Limited-Memory Variable-Metric อันดับ 1
เอ่อ-mma ‐ วิธีการเคลื่อนย้ายเส้นกำกับ
ld-lbfgs-nocedal - ไม่มี
ld-lbfgs - BFGS ที่เก็บข้อมูลต่ำ
gn-โดยตรง-l ‐ การแบ่งสี่เหลี่ยม (ลำเอียงเฉพาะที่)
ไม่มี - ไม่ระบุอัลกอรึทึม
ln-bobyqa ‐ การเพิ่มประสิทธิภาพแบบจำกัดขอบเขตที่ปราศจากอนุพันธ์
ln-sbplx - ตัวแปรย่อยของ Nelder-Mead
ln-newuoa-ผูกพัน ‐ การเพิ่มประสิทธิภาพแบบจำกัดขอบเขตที่ปราศจากอนุพันธ์โดย
การประมาณค่ากำลังสองที่สร้างซ้ำๆ
ln-แพรคซิส ‐ การเพิ่มประสิทธิภาพในพื้นที่ที่ไม่มีการไล่ระดับสีผ่านแกนหลัก
วิธี
gn-โดยตรง noscal - แบ่งสี่เหลี่ยม (ไม่มีมาตราส่วน)
ld-tnewton-precond-รีสตาร์ท - นิวตันที่ตัดทอนล่วงหน้าด้วย
การเริ่มต้นใหม่แบบชันที่สุด

ลด = -inf; สองเท่า
ขอบเขตล่าง (เท่ากับพารามิเตอร์ทั้งหมด)

แม็กซิเตอร์ = 100; int ใน [1, inf)
เกณฑ์การหยุด: จำนวนการวนซ้ำสูงสุด

เลือก = ld-lbfgs; คำสั่ง
อัลกอริทึมการย่อขนาดหลัก ค่าที่รองรับคือ:
gn-orig-โดยตรง-l ‐ การแบ่งสี่เหลี่ยม (การใช้งานดั้งเดิม,
ลำเอียงในท้องถิ่น)
g-mlsl-lds ‐ การเชื่อมโยงเดี่ยวหลายระดับ (ลำดับความคลาดเคลื่อนต่ำ
ต้องการการเพิ่มประสิทธิภาพและขอบเขตตามการไล่ระดับสีในท้องถิ่น)
gn-ตรง-l-noscal ‐ สี่เหลี่ยมผืนผ้าหาร
gn-isres - ปรับปรุงกลยุทธ์การวิวัฒนาการอันดับแบบสุ่ม
ld-tnewton - นิวตันที่ถูกตัดทอน
gn-ตรง-l-rand ‐ การแบ่งสี่เหลี่ยม (ลำเอียงเฉพาะที่ สุ่ม)
ln-newuoa ‐ อนุพันธ์ฟรีไม่มีข้อจำกัดการเพิ่มประสิทธิภาพโดย Iteratively
สร้างการประมาณกำลังสอง
gn-ตรง-l-แรนด์-noscale ‐ แบ่งสี่เหลี่ยม (ไม่มีมาตราส่วน เฉพาะที่
ลำเอียงสุ่ม)
gn-ต้นกำเนิดโดยตรง ‐ การแบ่งสี่เหลี่ยม (การใช้งานดั้งเดิม)
ld-tnewton-precond - นิวตันตัดปลายที่ปรับสภาพแล้ว
ld-tnewton-รีสตาร์ท ‐ ตัดทอนนิวตันด้วยการรีสตาร์ทที่ชันที่สุด
gn-ตรง - การแบ่งสี่เหลี่ยม
auglag-eq ‐ อัลกอริธึม Lagrangian ที่เสริมด้วยข้อจำกัดความเท่าเทียมกัน
เพียง
ln-neldermead - อัลกอริธึม Nelder-Mead simplex
ln-โคบีล่า ‐ การเพิ่มประสิทธิภาพที่มีข้อจำกัด โดยการประมาณเชิงเส้น
gn-crs2-lm - ควบคุมการค้นหาแบบสุ่มด้วยการกลายพันธุ์ในพื้นที่
ld-var2 ‐ Shifted Limited-Memory Variable-Metric อันดับ 2
ld-var1 ‐ Shifted Limited-Memory Variable-Metric อันดับ 1
เอ่อ-mma ‐ วิธีการเคลื่อนย้ายเส้นกำกับ
ld-lbfgs-nocedal - ไม่มี
g-mlsl ‐ ลิงค์เดียวหลายระดับ (ต้องการการปรับให้เหมาะสมในพื้นที่และ
ขอบเขต)
ld-lbfgs - BFGS ที่เก็บข้อมูลต่ำ
gn-โดยตรง-l ‐ การแบ่งสี่เหลี่ยม (ลำเอียงเฉพาะที่)
ln-bobyqa ‐ การเพิ่มประสิทธิภาพแบบจำกัดขอบเขตที่ปราศจากอนุพันธ์
ln-sbplx - ตัวแปรย่อยของ Nelder-Mead
ln-newuoa-ผูกพัน ‐ การเพิ่มประสิทธิภาพแบบจำกัดขอบเขตที่ปราศจากอนุพันธ์โดย
การประมาณค่ากำลังสองที่สร้างซ้ำๆ
ส.ค.ส - อัลกอริธึม Lagrangian เสริม
ln-แพรคซิส ‐ การเพิ่มประสิทธิภาพในพื้นที่ที่ไม่มีการไล่ระดับสีผ่านแกนหลัก
วิธี
gn-โดยตรง noscal - แบ่งสี่เหลี่ยม (ไม่มีมาตราส่วน)
ld-tnewton-precond-รีสตาร์ท - นิวตันที่ตัดทอนล่วงหน้าด้วย
การเริ่มต้นใหม่แบบชันที่สุด
ld-slsqp - การเขียนโปรแกรมกำลังสองน้อยที่สุดตามลำดับ

ขั้นตอน = 0; สองเท่าใน [0, inf)
ขนาดขั้นตอนเริ่มต้นสำหรับวิธีการที่ไม่มีการไล่ระดับสี

หยุด = -inf; สองเท่า
เกณฑ์การหยุด: ค่าฟังก์ชันต่ำกว่าค่านี้

เอ็กซ์โตลา = 0; สองเท่าใน [0, inf)
เกณฑ์การหยุด: การเปลี่ยนแปลงแบบสัมบูรณ์ของค่า x ทั้งหมดอยู่ต่ำกว่านี้
มูลค่า

xtolr = 0; สองเท่าใน [0, inf)
เกณฑ์การหยุด: การเปลี่ยนแปลงสัมพัทธ์ของค่า x ทั้งหมดต่ำกว่านี้
มูลค่า

ตัวอย่าง

ลงทะเบียนชุดการไหลเวียนโลหิตที่ให้ไว้ใน 'segment.set' โดยใช้การประมาณค่า ICA อัตโนมัติ
ข้ามสองภาพที่จุดเริ่มต้นและอย่างอื่นใช้พารามิเตอร์เริ่มต้น เก็บ
ส่งผลให้ 'registered.set'

mia-2dmyoica-full -i segment.set -o register.set -k 2

ผู้เขียน

เกิร์ท วอลนี่

ลิขสิทธิ์

ซอฟต์แวร์นี้เป็นลิขสิทธิ์ (c) 1999-2015 ไลป์ซิก เยอรมนี และมาดริด สเปน มันมา
โดยไม่มีการรับประกันใดๆ และคุณสามารถแจกจ่ายซ้ำได้ภายใต้เงื่อนไขของ GNU
ใบอนุญาตสาธารณะทั่วไป เวอร์ชัน 3 (หรือใหม่กว่า) สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม ให้รันโปรแกรมด้วยปุ่ม
ตัวเลือก '--ลิขสิทธิ์'

ใช้ mia-2dmyoica-full ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net