mia-3ddistance-stats - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

mia-3ddistance-stats - ประเมินสถิติระยะทางสำหรับรูปภาพสองภาพที่ติดป้ายกำกับ

เรื่องย่อ

mia-3distance-สถิติ -i -r -o [ตัวเลือก]

DESCRIPTION

mia-3distance-สถิติ โปรแกรมนี้ใช้ในการประเมินระยะห่างระหว่างกัน
พื้นที่ที่มีป้ายกำกับในสองภาพ ไฟล์ที่ส่งออกเป็นไฟล์ csv ที่มีระยะทางสำหรับ
พิกัดแต่ละป้ายในภาพทดสอบในรูปแบบต่อไปนี้:

ป้าย,n-ตัวอย่าง,ระยะทาง,ระยะทาง,...

โปรแกรม R อย่างง่ายเพื่อรับสถิติต่อฉลากจากข้อมูลนี้จะมีลักษณะดังนี้

args <- commandArgs(TRUE)
ข้อมูล <- read.csv(args[1], header=FALSE)
สำหรับ ( ใน 1:dim(data)[1] ) {
บรรทัด <- data[i,]
ป้ายกำกับ <- as.integer(line[1])
end_range <- 2 + as.numeric(line[2])
s <- as.numeric(line[3:end_range])
ผลลัพธ์ <- sprintf("%d %8.4f %8.4f %8.4f %8.4f0
ป้ายกำกับ, ค่าเฉลี่ย, sqrt(var(s)), ค่ามัธยฐาน, ค่าสูงสุด)
แมว(ผลลัพธ์)
}

OPTIONS

ไฟล์-IO
-i --in-labels=(อินพุต, จำเป็น); io
ใส่ภาพป้ายกำกับ สำหรับประเภทไฟล์ที่รองรับ โปรดดูที่ PLUGINS:3dimage/io

-r --ref-labels=(อินพุต, จำเป็น); io
รูปภาพฉลากอ้างอิง สำหรับประเภทไฟล์ที่รองรับ โปรดดูที่ PLUGINS:3dimage/io

-l --label-map=(อินพุต); สตริง
การทำแผนที่เสริมของหมายเลขฉลาก

-o --out-file=(เอาต์พุต, จำเป็น); สตริง
ชื่อไฟล์เอาต์พุตที่จะเขียนระยะทางไป ไฟล์ที่ส่งออกเป็นไฟล์ csv
มีระยะทางที่ระบุไว้สำหรับแต่ละป้าย

การช่วยเหลือ & ข้อมูล
-V --verbose=คำเตือน
ความละเอียดของผลลัพธ์ พิมพ์ข้อความในระดับที่กำหนดและลำดับความสำคัญที่สูงกว่า
ลำดับความสำคัญที่รองรับเริ่มต้นที่ระดับต่ำสุดคือ:
ข้อมูล - ข้อความระดับต่ำ
ติดตาม - การติดตามการเรียกใช้ฟังก์ชัน
ล้มเหลว - รายงานความล้มเหลวในการทดสอบ
คำเตือน - คำเตือน
ความผิดพลาด - รายงานข้อผิดพลาด
การแก้ปัญหา - ดีบักเอาท์พุต
ข่าวสาร - ข้อความปกติ
ร้ายแรง - รายงานเฉพาะข้อผิดพลาดร้ายแรง

--ลิขสิทธิ์
พิมพ์ข้อมูลลิขสิทธิ์

-h -- ช่วยด้วย
พิมพ์ความช่วยเหลือนี้

-? --การใช้งาน
พิมพ์ความช่วยเหลือสั้น ๆ

--รุ่น
พิมพ์หมายเลขรุ่นและออก

การประมวลผล
--กระทู้=-1
จำนวนเธรดสูงสุดที่จะใช้สำหรับการประมวลผล จำนวนนี้ควรต่ำกว่า
หรือเท่ากับจำนวนคอร์ตัวประมวลผลเชิงตรรกะในเครื่อง (-1:
การประมาณค่าอัตโนมัติ) จำนวนเธรดสูงสุดที่จะใช้สำหรับการประมวลผลนี้
จำนวนควรต่ำกว่าหรือเท่ากับจำนวนคอร์ตัวประมวลผลเชิงตรรกะใน
เครื่องจักร. (-1: การประมาณค่าอัตโนมัติ)

ปลั๊กอิน: ภาพ 3 มิติ/io

วิเคราะห์ วิเคราะห์ 7.5 ภาพ

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .HDR, .hdr

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ไม่ได้ลงนาม 8 บิต, ลงนาม 16 บิต, ลงนาม 32 บิต, ทศนิยม 32 บิต,
จุดลอยตัว 64 บิต

ฐานข้อมูล Virtual IO เข้าและออกจากพูลข้อมูลภายใน

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .@

ไดคอม ชุดภาพ Dicom เป็น 3D

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .DCM, .dcm

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
เซ็นชื่อ 16 บิต ไม่ได้ลงนาม 16 บิต

hdf5 ภาพ HDF5 3D IO

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .H5, .h5

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต,
เซ็นชื่อ 32 บิต, ไม่ได้ลงนาม 32 บิต, เซ็นชื่อ 64 บิต, ไม่ได้ลงชื่อ 64 บิต, ลอย
จุด 32 บิต จุดลอยตัว 64 บิต

อินเรีย ภาพ INRIA

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .INR, .inr

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต, เซ็นชื่อ32
บิต, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, จุดลอยตัว 32 บิต, จุดลอยตัว 64 บิต

mhd IO อิมเมจ MetaIO 3D โดยใช้การใช้งาน VTK (ทดลอง)

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต, เซ็นชื่อ32
บิต, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, จุดลอยตัว 32 บิต, จุดลอยตัว 64 บิต

นิฟตี ภาพสามมิติ NIFTI-1 IO

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .NII, .nii

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต, เซ็นชื่อ32
บิต, ไม่ได้ลงนาม 32 บิต, ลงนาม 64 บิต, ไม่ได้ลงนาม 64 บิต, จุดลอยตัว 32
บิต, จุดลอยตัว 64 บิต

วีเอฟเอฟ VFF รูปแบบแรสเตอร์ดวงอาทิตย์

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .VFF, .vff

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ไม่ได้ลงนาม 8 บิต ลงนาม 16 บิต

ทิวทัศน์ มุมมอง 3 มิติ

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .V, .VISTA, .v, .vista

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต,
เซ็นชื่อ 32 บิต, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, ทศนิยม 32 บิต, ทศนิยม 64
บิต

vti ภาพ 3 มิติ VTK-XML เข้าและออก (ทดลอง)

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .VTI, .vti

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต, เซ็นชื่อ32
บิต, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, จุดลอยตัว 32 บิต, จุดลอยตัว 64 บิต

vtk มรดกภาพ 3D VTK เข้าและออก (ทดลอง)

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต,
เซ็นชื่อ 32 บิต, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, ทศนิยม 32 บิต, ทศนิยม 64
บิต

ตัวอย่าง

ประเมินระยะทางสำหรับแต่ละป้ายกำกับที่มีใน image.v ถึงป้ายกำกับที่เกี่ยวข้องใน
ภาพ reference.v และเก็บผลลัพธ์เป็นรายการค่าที่คั่นด้วยอาการโคม่าเช่น
ระยะทาง.csv.

mia-3ddistance-stats -i image.v -r reference.v -o Distances.csv

ผู้เขียน

เกิร์ท วอลนี่

ลิขสิทธิ์

ซอฟต์แวร์นี้เป็นลิขสิทธิ์ (c) 1999-2015 ไลป์ซิก เยอรมนี และมาดริด สเปน มันมา
โดยไม่มีการรับประกันใดๆ และคุณสามารถแจกจ่ายซ้ำได้ภายใต้เงื่อนไขของ GNU
ใบอนุญาตสาธารณะทั่วไป เวอร์ชัน 3 (หรือใหม่กว่า) สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม ให้รันโปรแกรมด้วยปุ่ม
ตัวเลือก '--ลิขสิทธิ์'

ใช้ mia-3ddistance-stats ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net