นี่คือคำสั่ง njplot ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
njplot - โปรแกรมวาดต้นไม้สายวิวัฒนาการสำหรับนักชีววิทยา newicktops - วาดสายวิวัฒนาการ
ต้นไม้ลงในไฟล์ PostScript
เรื่องย่อ
พล็อต [ตัวเลือก] tree_file
ใหม่ [ตัวเลือก] tree_file
ใหม่icktotxt [ตัวเลือก] tree_file
DESCRIPTION
หน้าคู่มือนี้จัดทำเอกสารโดยสังเขปเกี่ยวกับ พล็อต คำสั่ง
เค้ก ใหม่ คำสั่งทำเหมือนกันทุกประการ แต่ไม่ต้องการจอแสดงผล X11 ผลลัพธ์คือ
แสดงผลเป็นไฟล์ PostScript
เค้ก ใหม่icktotxt คำสั่งทำเหมือนกับ ใหม่ แต่แสดงผลออกมาแล้ว
ลงในไฟล์ข้อความ
หน้าคู่มือนี้ถูกเขียนใหม่สำหรับการแจกจ่าย Debian GNU/Linux เนื่องจากต้นฉบับ
โปรแกรมไม่มีหน้าคู่มือ
พล็อต เป็นโปรแกรมวาดภาพต้นไม้ สามารถวาดต้นไม้เลขฐานสองหรือหลายแขนงที่แสดงออกมาได้
ในรูปแบบต้นไม้สายวิวัฒนาการมาตรฐาน (เช่น รูปแบบที่ใช้โดยแพ็คเกจ PHYLIP)
NJplot นั้นสะดวกเป็นพิเศษสำหรับการรูตต้นไม้ที่ไม่ได้ทำการรูทซึ่งได้มาจาก parsimony
วิธีปลูกต้นไม้ระยะทางหรือโอกาสสูงสุด
การรูทใดๆ ของทรีที่ยังไม่ได้รูทสามารถระบุแบบโต้ตอบได้โดยใช้เมาส์ NJplot
ยังอนุญาตให้ซูม สลับสาขา แสดงคะแนนบูตสแตรป และบันทึกใน
รูปแบบ PostScript NJplot สามารถใช้เป็นส่วนขยายกราฟิกของแพ็คเกจใดก็ได้
ของโปรแกรมสายวิวัฒนาการที่ใช้รูปแบบต้นไม้มาตรฐานในการจัดเก็บต้นไม้ (เช่น
ด้วยแพ็คเกจดังกล่าวส่วนใหญ่)
OPTIONS
มีเพียงตัวเลือกต่อไปนี้ซึ่งใช้ได้เฉพาะใน x-terminal-emulator แต่ไม่สามารถใช้ได้ใน
โหมดคอนโซล:
-h พิมพ์ความช่วยเหลือสั้นๆ
-เรา ไฟล์ Postscript tree ที่เตรียมไว้สำหรับขนาดกระดาษ US Letter
- คนเดียว
ไม่มีอินเทอร์เฟซของหน้าต่าง เพียงแค่เขียนไฟล์ทรี PostScript
-ขนาด n
ขนาดตัวอักษร n ใช้สำหรับชื่ออนุกรมวิธาน
-pc n จำนวนหน้าสำหรับเอาต์พุต PostScript
-ขนาด กว้างxสูง
ขนาดของหน้า PostScript แสดงเป็น WIDTHxHEIGHT
-ความยาว
แสดงความยาวของกิ่งหากปรากฏในไฟล์ทรี
- บูต แสดงค่าบูตสแตรปหากปรากฏในไฟล์ทรี
-ไม่มีชื่อเรื่อง
อย่าใส่ชื่อในเอาต์พุต PostScript
ใช้ njplot ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
