นี่คือแอพลินุกซ์ชื่อ BLAST Ring Image Generator ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น BRIG-0.95-dist.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ BLAST Ring Image Generator พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
ตัวสร้างภาพวงแหวน BLAST
DESCRIPTION
BRIG เป็นแอปพลิเคชันข้ามแพลตฟอร์ม (Windows/Mac/Unix) ที่สามารถแสดงการเปรียบเทียบแบบวงกลมระหว่างจีโนมจำนวนมาก โดยมุ่งเน้นที่การจัดการข้อมูลการประกอบจีโนมโปรดอ้างอิงเอกสาร BRIG หากใช้ BRIG เพื่อสร้างตัวเลขสำหรับสิ่งพิมพ์: NF Alikhan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): การเปรียบเทียบจีโนมโปรคาริโอตอย่างง่าย, BMC Genomics, 12:402 PMID: 21824423
คุณสมบัติ
- รูปภาพแสดงความคล้ายคลึงกันระหว่างลำดับอ้างอิงส่วนกลางกับลำดับอื่นๆ เป็นวงแหวนที่มีศูนย์กลาง
- BRIG จะทำการเปรียบเทียบ BLAST ทั้งหมดและแยกวิเคราะห์ไฟล์โดยอัตโนมัติผ่าน GUI อย่างง่าย
- สามารถแสดงขอบเขต Contig และขอบเขตการอ่านสำหรับจีโนมแบบร่างได้ สามารถแสดงกราฟและคำอธิบายประกอบที่กำหนดเองได้
- การใช้ชุดยีนที่กำหนดโดยผู้ใช้เป็นอินพุต BRIG สามารถแสดงการมีอยู่ของยีน การขาดหายไป การตัดทอน หรือการเปลี่ยนแปลงของลำดับในชุดของจีโนมที่สมบูรณ์ จีโนมแบบร่าง หรือแม้แต่ข้อมูลดิบที่ไม่ได้ประกอบเข้าด้วยกัน
- BRIG ยังยอมรับไฟล์การแมปการอ่านรูปแบบ SAM ซึ่งช่วยให้ภูมิภาคจีโนมมีอยู่ในข้อมูลลำดับที่ยังไม่ได้ประกอบจากตัวอย่างหลายตัวเพื่อเปรียบเทียบพร้อมกัน
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ภาษาโปรแกรม
ชวา
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/brig/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
