นี่คือแอป Linux ชื่อ FOCUS ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น FOCUS_0.31_python_2.7.XX.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ FOCUS พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
FOCUS
DESCRIPTION
FOCUS ซึ่งเป็นองค์ประกอบที่สร้างสรรค์และคล่องตัวโดยใช้กำลังสองน้อยที่สุดที่ไม่เป็นลบเพื่อสร้างโปรไฟล์และรายงานสิ่งมีชีวิตจำนวนมากที่มีอยู่ในตัวอย่าง me-tagenomic และความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ของพวกมันโดยไม่ต้องพึ่งพาความยาวตามลำดับ โปรแกรมได้รับการทดสอบด้วยเมตาจีโนมจำลองและของจริง และผลการทดลองแสดงให้เห็นว่าวิธีการของเราทำนายสิ่งมีชีวิตในชุมชนสุ่มความพร้อมใช้งานและการใช้งาน: โค้ดที่ใช้ใน Python สามารถพบได้ที่นี่และเว็บเซิร์ฟเวอร์ที่ http://edwards.sdsu.edu/FOCUS.
การพึ่งพา: แมงกะพรุน Numpy และ Scipy
อ้างอิง FOCUS
Silva, GGZ, DA Cuevas, BE Dutilh และ RA Edwards, 2014: FOCUS: แบบจำลองที่ไม่มีการจัดตำแหน่งเพื่อระบุสิ่งมีชีวิตในเมตาจีโนมโดยใช้กำลังสองน้อยที่สุดที่ไม่เป็นลบ PeerJ, 2, e425,ดอย:10.7717/peerj.425.
คุณสมบัติ
- เมตาจีโนม
- ความร่ำรวย
- ความสม่ำเสมอ
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/metagenomefocus/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา