นี่คือแอป Linux ชื่อ Hierachical_DNAcoder เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดเป็น Sourcecode.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ทางออนไลน์ที่ชื่อว่า Hierachical_DNAcoder เพื่อเรียกใช้ใน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
Hierachical_DNAcoder เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์
DESCRIPTION
การจัดเก็บและการถ่ายโอนข้อมูลของข้อมูลจีโนมขนาดใหญ่กลายเป็นข้อกังวลที่สำคัญสำหรับนักวิจัยด้านชีวการแพทย์ เรานำเสนอวิธีการบีบอัดจีโนมแบบอิงหลายตัวอ้างอิงแบบใหม่ที่มีโครงสร้างแบบลำดับชั้น วิธีการของเราใช้ได้กับการบีบอัดรูปแบบการจัดตำแหน่งมาตรฐานตามพฤตินัย (เช่น BAM) ซึ่งเป็นความต้องการเร่งด่วนในปัจจุบัน เราจัดเรียงลำดับใหม่เป็นลำดับอ้างอิงโดยใช้ SOAP3 ซึ่งเป็นซอฟต์แวร์ปรับแนวที่ใช้ GPU และสรุปคุณสมบัติการทำแผนที่และข้อมูลสำหรับการอ่านที่แมปที่แน่นอน เพื่อเพิ่มอัตราการจัดตำแหน่งที่แน่นอน เรายังปรับตำแหน่งการอ่านที่แมปและไม่แมปโดยประมาณใหม่โดยการเปลี่ยนลำดับการอ้างอิงหรือลดความยาวการอ่านให้สั้นลง ในขณะเดียวกัน เราทำการศึกษาเพิ่มเติมโดยใช้ค่าคุณภาพ "สูญเสีย" ผ่านรูปแบบการจัดกลุ่ม k-mean และพบผลกระทบเพียงเล็กน้อยต่อแอปพลิเคชันปลายทาง วิธีการที่เสนอมีอัตราส่วนกำลังอัดตั้งแต่ 0.5 ถึง 0.65 ซึ่งสอดคล้องกับการประหยัดพื้นที่ 35% -50% ในชุดข้อมูลทดลองคุณสมบัติ
- ที่มีประสิทธิภาพ
- รวดเร็ว
- แวว
ผู้ชม
เทคโนโลยีสารสนเทศ, วิทยาศาสตร์/การวิจัย, วิศวกรรมศาสตร์
ภาษาโปรแกรม
C + +
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/hierachicaldnac/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา