Name: ดาวน์โหลด ISVASE สำหรับ Linux
Brand: OnWorks
SKU: 4151a33748e3c950d820260d708df1ee
Availability: OnlineOnly
Rating: 4.95 (1509 reviews)

นี่คือแอป Linux ชื่อ ISVASE ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ ISVASE1.1.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน

ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ ISVASE พร้อม OnWorks ฟรี

ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:

- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ

- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ

- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว

- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้

- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ

- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้

ดาวน์โหลดแอป เรียกใช้ใน Ubuntu วิ่งใน Fedora เรียกใช้ใน Windows Sim เรียกใช้ใน MACOS Sim

ภาพหน้าจอ

ดาวน์โหลดเครื่องมือเว็บหรือเว็บแอป ISVASE

อิสวาเซ

DESCRIPTION

ในการสร้าง mRNA ที่โตเต็มที่จะต้องระบุ exons และเชื่อมต่อเข้าด้วยกันอย่างแม่นยำและมีประสิทธิภาพด้วยกลไกการประกบ RNA เป็นที่น่าสังเกตว่าประมาณหนึ่งในสามหรือครึ่งหนึ่งของการกลายพันธุ์ที่ก่อให้เกิดโรคทั้งหมดส่งผลต่อการประกบ RNA อย่างไรก็ตาม มีเครื่องมือชีวสารสนเทศเพียงเล็กน้อยในการระบุตัวแปรลำดับที่เกี่ยวข้องกับเหตุการณ์ splicing (SVASE) โดยตรงตามข้อมูล RNA-seq เราได้พัฒนา ISVASE ซึ่งเป็นเครื่องมือที่ง่ายและสะดวกสบายสำหรับการระบุ SVASE โดยตรงโดยใช้ข้อมูล RNA-seq เมื่อเปรียบเทียบกับซอฟต์แวร์ PVAAS ที่มีอยู่ วิธีการของเรามีข้อดีหลายประการ เช่น ตัวกรองที่ขึ้นกับกฎที่เข้มงวดและตัวกรองทางสถิติในแต่ละขั้นตอน ตัวแปรลำดับการตรวจจับสำหรับเหตุการณ์การต่อที่ทราบ ตัวแปรลำดับการระบุความแตกต่างในสองส่วนของการประกบ (จุดต่อ) แยกกัน การเปลี่ยนจุดแยกการตรวจจับ เหตุการณ์หากจัดให้มีหมายเหตุประกอบการประกบที่ทราบ การประเมินสัญญาณการประกบ เปรียบเทียบกับข้อมูลการกลายพันธุ์ของ DNA และ/หรือการแก้ไข RNA ที่ทราบ และระยะเวลาดำเนินการสั้น

คุณสมบัติ

เป็นเครื่องมือแรกในการระบุตัวแปรลำดับที่เกี่ยวข้องกับเหตุการณ์การประกบสำหรับทั้งรูปแบบการประกบใหม่และตัวแปรการประกบที่รู้จัก
ISVASE ระบุลำดับตัวแปรสำหรับตัวแปรประกบแต่ละตัวก่อน จากนั้นจึงระบุตัวแปรลำดับสำหรับตัวแปรการต่อพ่วงที่เกี่ยวข้องทั้งหมด (จุดเริ่มต้นหรือจุดต่อจุดเดียวกัน) สำหรับการวิเคราะห์เปรียบเทียบและการทดสอบทางสถิติ
ISVASE ระบุและตัดสินตัวแปรลำดับสำหรับทั้งสองส่วนของทางแยกแยกกัน ซึ่งสามารถแยกแยะผลกระทบของตัวแปรลำดับสำหรับส่วนต่างๆ ของทางแยกเพิ่มเติม
ISVASE ใช้ตัวกรองที่ขึ้นกับกฎที่เข้มงวดหลายตัวและตัวกรองทางสถิติในขั้นตอนต่างๆ
ISVASE พิจารณาเหตุการณ์การเปลี่ยนทางแยกและสัญญาณทางแยก (5' ss และ 3' ss) เพื่อลบตัวแปรการประกบเท็จ
ISVASE สามารถใช้ข้อมูลการกลายพันธุ์ของ DNA และการแก้ไข RNA ที่ผู้ใช้จัดเตรียมเพื่อกำหนดชนิดแหล่งที่มาของลำดับแวเรียนต์
ISVASE ได้รับลำดับขนาบข้างของลำดับแวเรียนต์สำหรับการค้นหาโมทีฟของการประกบ exonic splicing
ISVASE สามารถแปลงไฟล์รูปแบบลำดับเริ่มต้นเป็นไฟล์รูปแบบอินพุต ANNOVAR สำหรับคำอธิบายประกอบแบบแปรผัน
ISVASE ใช้ตัวเลข 8 ตัวเพื่อแสดงลักษณะของตัวแปรลำดับที่เกี่ยวข้องกับเหตุการณ์การประกบ

ผู้ชม

วิทยาศาสตร์/การวิจัย

ภาษาโปรแกรม

Perl

หมวดหมู่

วิทยาศาสตร์โมเลกุล ชีวสารสนเทศ

นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/isvase/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา