นี่คือแอป Linux ชื่อ KMC-KaiC ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ KMC_KaiC_Original.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ KMC-KaiC พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
KMC-ไก่C
DESCRIPTION
รหัสนี้เป็นอัลกอริธึม Kinetic Monte Carlo (KMC) โดยเฉพาะ ซึ่งจำลองแบบจำลองของนาฬิกา Kai circadian หลังการแปล
รหัสนี้อนุญาตให้คุณจำลองระบบ Kai ที่ระดับของเฮกซาเมอร์และโมโนเมอร์ของ KaiC แต่ละตัว และติดตามการหมุนเวียนของนิวคลีโอไทด์ ATP ทุกตัวอย่างชัดเจน นอกเหนือจากการไฮโดรไลซิสของ ATP แล้ว ปฏิกิริยาทั้งหมดยังเป็นไปตามความสมดุลโดยละเอียด
การใช้งานโค้ดได้อธิบายไว้ในบทความของเราเรื่อง "รูปแบบที่สอดคล้องกันทางอุณหพลศาสตร์ของนาฬิกา Kai circadian หลังการแปล" ซึ่งมีให้อ่านได้ฟรีที่วารสาร PLOS Computational Biology:
https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005415
*อัปเดต* เราได้สร้างแบบจำลองของเราแบบย้อนกลับได้ทั้งหมด รวมถึงปฏิกิริยาผกผันสำหรับการไฮโดรไลซิสของ ATP ทำให้สามารถเรียกใช้แบบจำลองที่สมดุลทางอุณหพลศาสตร์ได้ รุ่นของรุ่นนี้สามารถดาวน์โหลดได้ภายใต้ KMC_KaiC_Rev.zip
หากคุณต้องการใช้แบบจำลองของเราสำหรับการวิจัยของคุณเอง โปรดอ้างอิงเอกสาร PLoS Computational Biology ของเรา
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
บรรทัดคำสั่ง
ภาษาโปรแกรม
C + +
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/kmc-kaic/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
