นี่คือแอป Linux ชื่อ MGEScan ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น MGEScan1.3.1.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ MGEScan พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
MGESสแกน
Ad
DESCRIPTION
MGEScan คือชุดเครื่องมือซอฟต์แวร์สองชุด MGEScan-LTR และ MGEScan-non-LTR
MGEScan-LTR เป็นซอฟต์แวร์ที่สามารถระบุ LTR retrotransposons ใหม่โดยไม่ต้องอาศัยไลบรารีขององค์ประกอบที่รู้จัก ใช้เทคนิคการจับคู่สตริงโดยประมาณและการวิเคราะห์โดเมนโปรตีนเพื่อตรวจหา LTR retrotransposons ที่ไม่เสียหาย นอกจากนี้ยังระบุ LTR ที่ถูกลบบางส่วนหรือเดี่ยวโดยใช้โปรไฟล์ Hidden Markov Models (pHMMs)
MGEScan-non-LTR เป็นซอฟต์แวร์สำหรับระบุ retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR ในลำดับจีโนม ตามแนวทางการคำนวณที่ได้รับแรงบันดาลใจจากแบบจำลอง Markov ที่ซ่อนอยู่ทั่วไป (GHMM)
อ้างอิง:
1. M. Rho et al. "การระบุตัวตนของ LTR retrotransposons ในจีโนมของยูคาริโอต", BMC Genomics (2007) 8:90
2. M. Rho และ H. Tang, "MGEScan-non-LTR: การคำนวณระบุและการจำแนกประเภทของ retrotransposons ที่ไม่ใช่ LTR อิสระในจีโนมของยูคาริโอต", การวิจัยกรดนิวคลีอิก (2009) 37:21
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
บรรทัดคำสั่ง
ภาษาโปรแกรม
เพิร์ล, C++
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/mgescan/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
