misc genomics tools ดาวน์โหลดสำหรับ Linux

นี่คือแอพลินุกซ์ชื่อ misc genomics tools ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น misc_genomics_tools_v0.2.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน

ภาพหน้าจอ

เครื่องมือจีโนมเบ็ดเตล็ด

DESCRIPTION

นี่คือชุดของโปรแกรมต่างๆ ที่พัฒนาขึ้นในโครงการจีโนมที่เกี่ยวข้องกับเชื้อ Pseudomonas สายพันธุ์ NCIMB10586
เหล่านี้รวมถึง
* ระบุและแก้ไขข้อผิดพลาดใน (เช่น) ลำดับจีโนม pacbio โดยใช้ illumina reads
* ลำดับโปรคาริโอต/คำอธิบายประกอบจีโนม
* การวิเคราะห์ RNAseq - การทำให้เป็นมาตรฐานและการเรียงตัวอย่างหลายตัวอย่างเป็นกลุ่ม
* การสร้างภาพ RNAseq

สคริปต์ทั้งหมดจัดทำขึ้นโดยใช้ 'ความพยายามอย่างดีที่สุด' อย่างไรก็ตาม เนื่องจากการเปลี่ยนแปลงระบบต่างๆ ฉันไม่รับประกันว่าไฟล์ทั้งหมดจะเป็นเวอร์ชันที่ใช้ในการวิเคราะห์
นอกจากนี้ โปรดทราบว่าสิ่งเหล่านี้ได้รับการพัฒนาอย่างมากโดยคำนึงถึงความเหมาะสม นั่นคือ กระบวนการนี้คาดว่าจะดำเนินการในรูปแบบสุดท้ายครั้งเดียว มีการเอาใจใส่เพียงเล็กน้อยในการเพิ่มประสิทธิภาพรันไทม์หรือการเชื่อมโยงสคริปต์เข้าด้วยกัน และบางครั้งมีการเข้าถึงทรัพยากรภายนอกด้วยตนเอง

คุณสมบัติ

• การแก้ไขข้อผิดพลาดลำดับจีโนม
• คำอธิบายประกอบลำดับ Prokaryotic
• การทำให้เป็นมาตรฐาน RNAseq ของตัวอย่างหลายตัวอย่างเป็นกลุ่ม
• RNAseq ตัวอย่างซีรีส์/การแสดงภาพหลักสูตรเวลา

ผู้ชม

วิทยาศาสตร์/การวิจัย

ภาษาโปรแกรม

Perl

หมวดหมู่

นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา