นี่คือแอป Linux ชื่อ SplitMEM ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น splitmem.1.0.tgz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ SplitMEM พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
แยกMEM
Ad
DESCRIPTION
ด้วยการเพิ่มขึ้นของเทคโนโลยีการจัดลำดับที่พัฒนาขึ้น จีโนมกำลังขยายจากการอ้างอิงเดียวต่อกระบวนทัศน์ของสปีชีส์ไปสู่แนวทางแพน-จีโนมที่ครอบคลุมมากขึ้น โดยมีบุคคลหลายคนแสดงและวิเคราะห์ร่วมกัน ในที่นี้ เราขอแนะนำอัลกอริธึมเวลาและพื้นที่ O(n log n) แบบใหม่ที่เรียกว่า splitMEM ซึ่งสร้างกราฟ de Bruijn ที่ถูกบีบอัดโดยตรงสำหรับ pan-genome ของความยาวทั้งหมด n เพื่อให้บรรลุความซับซ้อนในเวลานี้ เราเสริมทรีส่วนต่อท้ายด้วยการข้ามส่วนต่อท้าย ซึ่งเป็นโครงสร้างใหม่ที่ช่วยให้เราสามารถสำรวจลิงก์ส่วนต่อท้ายหลายลิงก์ในเวลาคงที่ และใช้พวกมันเพื่อแยกส่วนการจับคู่ที่ตรงกันสูงสุด (MEM) อย่างมีประสิทธิภาพระหว่างการสำรวจต้นไม้ส่วนต่อท้าย
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
บรรทัดคำสั่ง
ภาษาโปรแกรม
C + +
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/splitmem/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา