นี่คือแอป Windows ชื่อ gsasnp2 ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น gsasnp2-linux-cmd-ubuntu.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ gsasnp2 พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OS OnWorks จากเว็บไซต์นี้ แต่โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows ที่ดีกว่า
- 5. จากระบบปฏิบัติการ Windows ของ OnWorks ที่คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นและติดตั้ง
- 7. ดาวน์โหลดไวน์จากที่เก็บซอฟต์แวร์ลีนุกซ์ดิสทริบิวชันของคุณ เมื่อติดตั้งแล้ว คุณสามารถดับเบิลคลิกที่แอปเพื่อเรียกใช้แอปด้วย Wine คุณยังสามารถลองใช้ PlayOnLinux ซึ่งเป็นอินเทอร์เฟซแฟนซีบน Wine ที่จะช่วยคุณติดตั้งโปรแกรมและเกมยอดนิยมของ Windows
ไวน์เป็นวิธีเรียกใช้ซอฟต์แวร์ Windows บน Linux แต่ไม่จำเป็นต้องใช้ Windows Wine เป็นเลเยอร์ความเข้ากันได้ของ Windows แบบโอเพ่นซอร์สที่สามารถเรียกใช้โปรแกรม Windows ได้โดยตรงบนเดสก์ท็อป Linux โดยพื้นฐานแล้ว Wine พยายามนำ Windows กลับมาใช้ใหม่ให้เพียงพอตั้งแต่เริ่มต้น เพื่อให้สามารถเรียกใช้แอปพลิเคชัน Windows เหล่านั้นทั้งหมดโดยไม่จำเป็นต้องใช้ Windows จริงๆ
ภาพหน้าจอ
Ad
gsasnp2
DESCRIPTION
* GSA-SNP2 เป็นตัวตายตัวแทนของ GSA-SNP (Nam et al. 2010, ปัญหาเว็บเซิร์ฟเวอร์ NAR) GSA-SNP2 ยอมรับข้อมูลสรุป GWAS ของมนุษย์ (ตัวเลข rs, ค่า p) หรือค่า p ที่ชาญฉลาดของยีน และเอาต์พุตของยีนชุดเส้นทาง 'เสริม' ด้วยยีนที่เกี่ยวข้องกับฟีโนไทป์ที่กำหนด นอกจากนี้ยังจัดให้มีเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนทั้งในระดับท้องถิ่นและระดับโลกในวิถีทางที่เกี่ยวข้อง
* บทความ: SYoon, HCTNguyen, YJYoo, JKim, BBaik, SKim, JKim, SKim, DNam, "การปรับปรุงเส้นทางอย่างมีประสิทธิภาพและการวิเคราะห์เครือข่ายของข้อมูลสรุป GWAS โดยใช้ GSA-SNP2", การวิจัยกรดนิวคลีอิก, ฉบับที่. 46(10), e60(2018).
* รหัส PubMed: 29562348
* ดอย: 10.1093/nar/gky175
-> โปรดย้ายหรือทำสำเนาโฟลเดอร์ 'ข้อมูล' ลงในโฟลเดอร์การทดสอบที่เข้มข้นของคุณ (เช่น โฟลเดอร์ที่ระบุของ LINUX, MAC หรือ WINDOWS) เพื่ออนุญาตให้โปรแกรมค้นหาข้อมูลที่กำหนดไว้ล่วงหน้า
* อัปเดตหมายเหตุ:
-> Sep-1-2020: เพิ่มการอัปเดตสำหรับ Ubuntu-20.04 คุณจะต้องติดตั้งไลบรารี Boost (sudo apt-get install libboost-all-dev)
-> มี.ค.-7-2018: แก้ไขเงื่อนไขส่วนหัวในไฟล์เอาต์พุต
คุณสมบัติ
- 1/ 'การควบคุมข้อผิดพลาดประเภทที่ XNUMX' ทำได้โดยสองกระบวนการต่อไปนี้: A) คะแนนของยีน 'ถูกปรับ' ตามจำนวนของ SNP ที่กำหนดให้กับแต่ละยีนโดยใช้เส้นโค้งแนวโน้มเส้นโค้งลูกบาศก์โมโนโทน B) ยีนที่อยู่ติดกันซึ่งมีความสัมพันธ์ระหว่างยีนสูงภายในแต่ละวิถีจะถูกลบออก
- 2/ 'พลังสูงและการคำนวณที่รวดเร็ว' ตามโมเดลชุดสุ่ม
- 3/ 'ไม่มีพารามิเตอร์ที่สำคัญฟรี'
- 4/ 'PROTEIN INTERACTION NETWORKS' ในบรรดายีนของสมาชิกได้รับการมองเห็นสำหรับเส้นทางที่สำคัญ ฟังก์ชันนี้ช่วยให้ผู้ใช้จัดลำดับความสำคัญของเครือข่ายย่อยหลักภายในและข้ามเส้นทางที่สำคัญได้ ปัจจุบันมีเครือข่าย STRING และ HIPPIE ให้
- 5 / 'ใช้งานง่าย': ต้องการเพียงข้อมูลสรุปของ GWAS (หรือค่ายีน p) และใช้เวลาเพียงหนึ่งหรือสองนาทีเพื่อให้ได้ผลลัพธ์ เครื่องมือพาธเวย์ในตัวที่ทรงพลังอื่นๆ นั้นต้องการอินพุตสหสัมพันธ์ SNP เช่นกัน และใช้เวลานานกว่ามาก ผู้ใช้ยังสามารถอัปโหลดชุดยีนเส้นทางและเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนได้อีกด้วย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
Win32 (MS Windows), บรรทัดคำสั่ง
ภาษาโปรแกรม
C++, PHP, จาวาสคริปต์
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/gsasnp2/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
