bp_chaos_plotp - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

bp_chaos_plot - isang chaos plot mula sa DNA at RNA sequence

SINOPSIS

bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=OUTPUTFILE -g/--graphics=GRAPHIC FORMAT
-w/--width=WIGHT -h/--height=HEIGHT

DESCRIPTION

Ang mga script na ito ay bumubuo ng mga file ng imahe gamit ang GD image library upang mailarawan ang nucleotide
pagkakasunud-sunod gamit ang chaos plot.

Opsyon

Ang mga wastong format ng graphics ay kasalukuyang gd, gd2, png, wbmp, jpeg at gif.

Ang default na laki ng image file ay 600x400.

Maaaring ibigay ang sequence input gamit ang alinman sa tatlong pamamaraan:

hindi pinangalanang argumento
bp_chaos_plot filename

pinangalanang argumento
bp_chaos_plot -i filename

karaniwang input
bp_chaos_plot < filename

Feedback

Mailing Mga Listahan
Ang feedback ng user ay isang mahalagang bahagi ng ebolusyon nito at ng iba pang mga module ng Bioperl. Ipadala
ang iyong mga komento at suhestiyon ay mas mabuti sa mailing list ng Bioperl. Ang iyong pakikilahok
ay labis na pinahahalagahan.

[protektado ng email] - Pangkalahatang talakayan
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Tungkol sa mga mailing list

Pag-uulat Bug
Mag-ulat ng mga bug sa Bioperl bug tracking system upang matulungan kaming subaybayan ang mga bug at ang mga ito
resolusyon. Maaaring isumite ang mga ulat ng bug sa pamamagitan ng web:

https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues

AUTHOR - Jason Stajich

Email [protektado ng email]

KASAYSAYAN

Ang code na ito ay batay sa EMBOSS C code para sa chaos.c ni Ian Longden. Kasama ay
dokumentasyon mula sa EMBOSS code:

Ang kaguluhan ay gumagawa ng isang balangkas ng kaguluhan. Ang orihinal na aplikasyon ay bahagi ng ACEDB genome
database package, isinulat ni ** Richard Durbin (MRC LMB, UK) [protektado ng email], at
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS, France) [protektado ng email]

Gamitin ang bp_chaos_plotp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net