Ito ang command na bp_seqretp na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
bp_seqret - pagpapatupad ng bioperl ng sequence fetch mula sa lokal na db (tulad ng EMBOSS seqret)
PAGGAMIT
bp_seqret [-f/--format outputformat] [-o/--out/--outfile outfile] [-d/--db dbname]
[-i/--id/-s/--seqname seqname1]
Halimbawa ng paggamit:
bp_seqret -f fasta -db db.fa -i seq1 -i seq2 > output.fas
bp_seqret db.fa:seq1 output.fas
bp_seqret db.fa:seq1 -o output.fas
bp_seqret -db db.fa -o output.fas seq1 seq2 seq3
bp_seqret -db db.fa seq1 seq2 seq3 output.fas
bp_seqret -db db.fa seq1 seq2 seq3 - > output.fas
Ang DB ay inaasahang magiging isang Fasta formatted sequence file na may maraming sequence.
Ang format ng output ay Fasta bilang default.
Kung walang ibinigay na output filename, isusulat ang output sa STDOUT. Nagbibigay ng '-' bilang ang
ang output filename ay makakamit ang parehong bagay.
Gamitin ang bp_seqretp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
