cmtk-unwarp_image_phantom - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

unwarp_image_phantom - Lumikha ng pagbabago upang i-unwarp ang isang imahe batay sa isang phantom
paglalarawan

SINOPSIS

unwarp_image_phantom InputPhantom InputImage OutputXform

DESCRIPTION

Kinakalkula ng tool na ito ang alinman sa polynomial transformation o B-spline free-form deformation sa
i-unwarp ang isang imahe. Ang pagbabago ay batay sa inaasahan at natukoy na mga palatandaan sa isang
imahe ng isang structural phantom na nakuha sa parehong scanner. Gamitin ang 'detect_adni_phantom'
tool upang makita ang mga landmark ng ADNI Phantom sa isang imahe at bumuo ng isang phantom
paglalarawan ng file na angkop para gamitin sa tool na ito.

Opsyon

Global Toolkit Options (ito ay Nagbahagi by lahat CMTK kasangkapan)
- Tumulong
Sumulat ng listahan ng mga pangunahing opsyon sa command line sa karaniwang output.

--tulong-lahat
Sumulat ng kumpletong listahan ng basic at advanced na mga opsyon sa command line sa karaniwang output.

--wiki
Isulat ang listahan ng mga opsyon sa command line sa karaniwang output sa MediaWiki markup.

--lalaki
Isulat ang man page source sa 'nroff' markup sa karaniwang output.

--bersyon
Isulat ang bersyon ng toolkit sa karaniwang output.

--echo
Isulat ang kasalukuyang command line sa karaniwang output.

--verbose-level
Itakda ang antas ng verbosity.

--verbose, -v
Dagdagan ang antas ng verbosity ng 1 (hindi na ginagamit; suportado para sa backward compatibility).

--mga thread
Itakda ang maximum na bilang ng mga parallel na thread (para sa POSIX thread at OpenMP).

Agpang Options
--fit-inverse
Pagkasyahin ang inverse transformation (aktwal na pagmamapa sa inaasahang mga landmark na lokasyon). Ito ay
kapaki-pakinabang para sa pag-compute ng Jacobian volume correction map (gamit ang 'reformatx') nang wala
kinakailangang baligtarin ayon sa numero ang nilagyan ng unwarping transformation.

--fit-forward
Fit forward transformation (inaasahan ang pagmamapa sa mga aktwal na landmark na lokasyon). Ito ay
kapaki-pakinabang para sa pagwawasto ng imahe sa pamamagitan ng reslicing (gamit ang 'reformatx'). [Ito is ang
default]

Pagbabagong-anyo Modellen
--spline
Pagkasyahin ang B-spline free-form na pagpapapangit.

--poly
Pagkasyahin ang polynomial transformation. [Ito is ang default]

Polinomyal Agpang Options (may --poly)
--degree
Degree ng fitted polynomial transformation. [Default: 4]

B-Spline Agpang Options (may --spline)
--final-cp-spacing
Panghuling control point grid spacing ng output B-spline transformation. [Default: 0]

--final-cp-dims
Panghuling mga sukat ng grid ng control point (ibig sabihin, bilang ng mga control point) ng output B-
pagbabagong-anyo ng spline. Ibibigay bilang 'dimX,dimY,dimZ'. [Default: WALA]

--mga antas
Bilang ng mga antas sa multi-level na B-spline approximation procedure. [Default: 1]

--iteration-per-level
Pinakamataas na bilang ng mga pag-uulit ng pag-update ng spline coefficient bawat antas sa multi-level
B-spline approximation procedure. [Default: 100]

--rms-threshold
Threshold para sa relatibong pagpapabuti ng natitirang RMS fitting. Ang angkop na pag-ulit
magwawakas kung (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate)/rmsBeforeUpdate < threshold.
[Default: 0]

--no-fit-affine
I-disable ang fitting ng affine transformation para masimulan ang spline. Sa halip, magkasya ang spline
direkta. Ito ay kadalasang nagbibigay ng mas masahol na mga resulta at nasiraan ng loob.

MGA AUTHORS

Torsten Rohlfing, na may mga kontribusyon mula kay Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, at Yaroslav Halchenko

Gumamit ng cmtk-unwarp_image_phantom online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net