Ito ang command delta2blocks na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
delta2blocks - dagdag na tool para sa mummer mula sa patch ng mugsy upang ayusin ang mga pagkakahanay
delta2maf - dagdag na tool para sa mummer mula sa patch ng mugsy upang ayusin ang mga pagkakahanay
SINOPSIS
delta2blocks [mga pagpipilian]<refID><qryID>
delta2maf [mga pagpipilian]<refID><qryID>
DESCRIPTION
-h Ipakita ang impormasyon ng tulong
-q Pagbukud-bukurin ang mga alignment ayon sa query start coordinate
-r Pagbukud-bukurin ang mga alignment ayon sa reference start coordinate
-w int Itakda ang lapad ng screen - ang default ay 60
-x int Itakda ang uri ng matrix - ang default ay 2 (BLOSUM 62), kasama sa iba pang mga opsyon ang 1 (BLOSUM 45)
at 3 (BLOSUM 80)
tandaan: may epekto lamang sa mga pagkakahanay ng amino acid
Ang input ay ang .delta output ng alinman sa "nucmer" o "promer" na programa na ipinasa sa
command line.
Ang output ay sa stdout, at binubuo ng lahat ng pagkakahanay sa pagitan ng query at reference
pagkakasunud-sunod na natukoy sa command line.
TANDAAN: Walang pagbubukod-bukod na ginagawa bilang default, samakatuwid ang mga pagkakahanay ay iuutos ayon sa makikita sa
ang input.
Gumamit ng delta2blocks online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
