Ito ang command na EDTSurf na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
EDTSurf - mabilis at tumpak na pagbuo ng mga macromolecular na ibabaw
SINOPSIS
EDTSurf -i pdbname...
DESCRIPTION
Ang EDTSurf ay isang open source na programa upang bumuo ng mga triangulated na ibabaw para sa mga macromolecule. Ito
bumubuo ng tatlong pangunahing macromolecular na ibabaw: ibabaw ng van der Waals, naa-access ng solvent
ibabaw at molecular surface (solvent-excluded surface). Tinutukoy din ng EDTsurf ang mga cavity
na nasa loob ng macromolecules.
Opsyon
-o outname
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-purong 2-atom 3-chain
-p probe radius [0,2.0]
-f scale factor (0,20.0]
-h 1-in at out 2-out 3-in
output1: outname.ply
output2: outname.asa
output3: outname-cav.pdb
Gamitin ang EDTSurf online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
