Ito ang command existDB na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
existDB - pamamahala ng mga existDB file
SINOPSIS
existDB [-mersize mersize] -buuin ilang.fasta unlapi
existDB -ilarawan unlapi
existDB -testfiles ilang.fasta unlapi
existDB -testexistence ilang.fasta
existDB -testekshaustive ilang.fasta ilang.meryl
DESCRIPTION
Ang program na ito ay bahagi ng libkmer.
Opsyon
-mersize mersize
Gamitin ang tinukoy mersize kapag nagtatayo existDB mga talahanayan.
-buuin ilang.fasta unlapi
Bumuo ng isang existDB sa lahat ng mers in ilang.fasta at i-save ang mga talahanayan sa unlapi.
-ilarawan unlapi
Iniuulat ang kalagayan ng ilan existDB file.
-testfiles ilang.fasta unlapi
Bumuo ng isang existDB mesa mula sa ilang.fasta. Isulat ang talahanayan na iyon sa disk. Ikarga ang mesa
pabalik. Ikumpara ang bawat mer in ilang.fasta ay naroroon sa lahat ng tatlo existDB tables
nilikha ng mas maaga.
-testexistence ilang.fasta
Bumuo ng isang existDB mesa mula sa ilang.fasta, suriin na ang bawat mer in ilang.fasta ay maaaring maging
matatagpuan sa talahanayan. Hindi ginagarantiyahan na ang bawat mer sa talahanayan ay matatagpuan sa
file.
-testekshaustive ilang.fasta ilang.meryl
Bumuo ng isang existDB mesa mula sa ilang.fasta, suriin ang _EVERY_ mer para sa pagkakaroon. Magreklamo
kung mayroong isang mer sa talahanayan ngunit wala sa meryl(1) database. Ipinagpapalagay ilang.meryl
ay ang mercount ng ilang.fasta.
Gamitin ang existDB online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
